远志属Polygala L. 是一个世界性分布的大属,尤以热带、亚热带为盛,约500种[1],传统分类分为10个组[2]或12个亚属[3]。我国有3个亚属,42种8变种,全国分布,以西南和华南地区最多,3个亚属分别是黄杨亚属、小扁豆亚属和远志亚属[1, 4]。远志属植物含有丰富的三萜皂苷、酮、寡糖酯类成分及其他活性成分,组成该属植物生理活性的有效物质群,该属植物有镇咳、祛痰、益智、安定、解毒消肿、补益强壮等作用[5, 6]。在临床和民间常用于心神不安、惊悸失眠健忘、咳痰不爽、疮疡肿毒等[6]。肾果小扁豆Polygala furcata Royle、瓜子金P. japonica Houtt.、远志P. tenuifolia Willd.、华南远志P. glomerata Lour.、蓼叶远志P. persicariifolia DC. 卵叶远志P. sibirica L. 及小花远志P. arvensis Willd. 为常见的远志属药用植物,近年来,在化学成分、HPLC指纹图谱、遗传多样性、组织培养和药理作用等方面有一些相关研究[7, 8, 9]。
核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列由于长度保守、信息位点丰富、核苷酸变异快,已被广泛用于植物种间、属间和科内的系统发育与分类研究[10, 11, 12]。近年来,在药用植物分子鉴定、遗传多样性、系统分类等方面有大量研究[9, 13, 14],而有关用ITS序列鉴定远志属药用植物的研究未见报道。本研究通过测定ITS1、ITS2序列,构建远志属7种植物的系统发育树,从分子系统学角度探讨其亲缘关系,同时为远志属药用植物分子鉴定提供参考。
1 材料和方法 1.1 材料远志Polygala tenuifolia Willd.(山西盂县和灵丘)和卵叶远志Polygala sibirica L.(山西盂县)由山西中医学院樊杰讲师鉴定。肾果小扁豆Polygala furcata Royle、华南远志Polygala glomerata Lour. 及小花远志Polygala arvensis Willd. 的叶片材料取自中国科学院植物所标本馆。从GenBank数据库获得另外3个种的ITS序列3条,材料来源和GenBank 数据见表 1。
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表 1 样品来源 Table 1 Sample sources |
DNA的制备采用改良CTAB法,但无法获得进行后续PCR的DNA,根据文献报道 [15]对实验环节略作调整,水浴温度45 ℃,水浴5 h,加异丙醇沉淀1 h。
1.3 ITS1、ITS2序列的PCR扩增及测序引物参考文献中的引物[14],ITS片段均无法一次完成PCR扩增,所以分为ITS1和ITS2两段扩增。使用的引物包括ITS正向:5’-CGAGAAGTCCAC-TGAACCTTATC-3’和ITS反向:5’-TCTTYTCCTC-CGCTTATTGATATGC-3’;ITS internal 反向:5’-GCGTTCAAAGACTCGATGGTTC-3’和ITS internal正向:5’-GACTCTCGGCAACGGATATCTCGGC-3’。PCR反应在PTC-200型PCR仪上进行。PCR总体积为25 μL,包括:12.5 μL Mix(Takara Premix Taq),10 μm引物各0.5 μL,0.5~1 μL模板(10~50 ng),用灭菌超纯水补足反应体积。扩增程序为:94 ℃、3 min,33 个循环:94 ℃、1 min,58 ℃、1 min,72 ℃、80 s,72 ℃、6 min。PCR产物10 μL用1%琼脂糖凝胶电泳检测。PCR产物送华大基因测序。
1.4 序列提交和分析序列通过Sequin软件提交至NCBI 数据库,并获得相应登录号。ClustalX 1.81软件用于序列比对,采用MEGA 3.1软件计算遗传距离并构建系统发育树。
2 结果与分析 2.1 ITS1、ITS2序列比较测序结果表明,序列中除ITS1和ITS2的全长外,还包含5.8、18、28 S的部分序列,远志属4种药用植物的ITS序列已提交至NCBI,GenBank登录号和对应的植物名称见表 1。序列分析结果表明,远志属7种药用植物ITS1长度为279~291 bp,(G+C)量为55.6%~62.5%;ITS2的长度为211~219 bp,(G+C)量为59.3%~65.0%。结果见表 2。
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表 2 远志属7种药用植物ITS1、ITS2序列长度及(G+C)量 Table 2 Length and G + C contents of ITS1 and ITS2 sequences of seven medicinal plants in Polygala L. |
利用Clustal X 1.81软件分别对ITS1和ITS2的9个序列进行比对,结果表明,ITS1和ITS2结果类似,ITS1序列远志与卵叶远志之间差异最小,仅存在1个碱基的差别,其余种间差别都很大;ITS2序列远志与卵叶远志之间差异最小,仅存在1个碱基的差别,瓜子金与远志有2个碱基差异,与卵叶远志有3个碱基的差异;其余种间差别都很大。
2.2 系统发育分析利用MEGA 3.1软件计算ITS1和ITS2的变异位点及信息位点,结果表明,ITS1含144个变异位点和35个信息位点,分别占总位点数的42.48%和10.32%;而ITS2序列中的变异位点和信息位点分别为88和18个,占总位点数的37.93%和7.76%。利用MEGA 3.1的Kimura 2-parameter计算6种药用植物之间的遗传距离,结果表明,远志的2个样品及卵叶远志的2个样品之间遗传距离为0,远志与卵叶远志之间的遗传距离为0.006,两者的亲缘关系为种间最近;华南远志与肾果小扁豆之间遗传距离最大,达0.472,两者关系最远(表 3)。
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表 3 远志属7种药用植物的遗传距离 Table 3 Genetic distances among seven medicinal plants in Polygala L. |
基于ITS1和ITS2序列,采用NJ法构建了系统发育树,经1 000次自举检测,结果(图 1)表明,亲缘关系较近的卵叶远志与远志处于同一分支,并得到100%支持;瓜子金与小花远志聚为一支,支持率中等(63%)。与它们遗传距离较远的蓼叶远志、华南远志、肾果小扁豆依次各自成一支。
![]() | 图 1 基于ITS1和ITS2序列构建的系统发育树Fig. 1 Phylogenetic tree based on ITS1 and ITS2 sequences |
ITS 序列分析技术具有技术简单、结果准确、重复性好等优点,近年来广泛应用于药用植物鉴定,是药学研究中的一种重要分子标记[16]。其中ITS2被认为比ITS1具有更多的信息位点,具有更高的鉴定效率[17, 18]。但本研究并不支持这一结论,ITS1序列中的信息位点占总位点数的10.32%略高于ITS2 的7.76%。
本研究以7种远志属药用植物为材料,利用PCR技术分离、测定了其中5种的ITS1、ITS2序列,并提交至NCBI数据库,丰富了GenBank数据库中远志属植物的序列信息。卵叶远志和远志同为药材远志的基源植物[19],两者在形态上十分相似,药材也较难区别,基于ITS序列建立的系统发育树也支持这一观点,二者是7种药用植物中遗传距离最小的。ITS序列可用于植物种间、属间和科内的系统发育与分类,本研究中,远志属植物在ITS序列上存几个到几十个碱基的差异,变异位点和信息位点丰富,ITS序列可作为远志属7种药用植物之间鉴定的分子标记。
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