在过去的几十年中，天然产物在新药研发中发挥着重要的作用^[1]。而在天然产物的来源中，除植物外，微生物是主要来源，以放线菌贡献最大。根据Bérdy的统计，从微生物获得的34 000种天然活性物质中，有35%以上来源于放线菌，其中链霉菌为主要贡献者^[2]。从放线菌中获得的代谢产物可分为抗生素、抗癌物质、免疫抑制剂、植物生长激素和酶。经过几十年的筛选，从土壤中筛选出能产生天然活性物质的放线菌日益困难，因此，人们逐渐把目光投向以前很少研究的领域如植物内部^[3,4,5]，以寻找产生新活性物质的放线菌资源。

植物内生放线菌（endophytic actinobacteria）是指那些在其生活史的一定或全部阶段生活于健康植物组织内部，而不使宿主植物表现出明显感染症状的放线菌^[6]。其广泛分布于植物的根、茎、叶、花、果实、种子中。按照“内共生理论”，内生菌可能产生与其宿主相同或相似的代谢产物^[7]。因此，从药用植物中分离放线菌资源，并从中分离具有抗菌、抗肿瘤、抗病毒的天然活性物质来代替药用植物，这样不仅可以减少药用植物特别是一些濒危药用植物资源的过度开发，保护药用植物资源，而且也为新药的研发提供了新的途径，具有重要的生态学意义和经济价值。本文就药用植物内生放线菌的多样性、次生代谢产物相关合成基因和代谢产物的研究进行综述，以期为药用植物内生放线菌资源的开发研究提供参考。

目前的研究表明，内生放线菌几乎存在于所有研究过的药用植物中，分布广、种类多。链霉菌属Streptomyces Waksman et Henrici 仍为药用植物内生放线菌中最大的类群，小单孢菌属Micromonospora Ørskov、小双孢菌属Microbispora Nonomura et Ohara、诺卡氏菌属Nocardia Trevisan、拟诺卡氏菌属Nocardiopsis Brocq-Rousseau、链孢子囊菌属Streptosporangium Couch、野野村氏菌属Nonomuraea Zhang等为药用植物常见内生放线菌类群。Zhao等^[5]从攀西地区采集的26种药用植物中分离得到内生放线菌560株，经鉴定所有菌株分别属于链霉菌属、厄氏菌属Oerskovia Prauser、野野村菌属、小单孢菌属、原小单孢菌属Promicromonospora Krasil'nikov和红球菌属Rhodococcus Zopf6个属，其中链霉菌属占到分离菌株的85%。从泰国36种药用植物中分离得到330株内生放线菌，经鉴定分别属于链霉菌属、小双孢菌属、诺卡氏菌属和小单孢菌属4个属，其中链霉菌属占到84%^[8]。Vijay等^[9]从印楝Azadirachta indica A. Juss中分离得到55株内生放线菌，分布于链霉菌属、链孢子囊菌属、小双孢菌属、轮枝链霉菌属Streptoverticillium Baldacci、糖单孢菌属Saccharomonospora Nonomura et Ohara、诺卡氏菌属6个不同的属中。药用植物内生放线菌见表 1。

表 1(Table 1)

表 1 药用植物内生放线菌的多样性 Table 1 Diversity of endophytic actinobacteria in medicinal plants 宿主植物 科 内生放线菌（属） 文献 老鼠簕Acanthus ilicifolius 爵床科 Acanthaceae 小单孢菌属、链霉菌属、疣孢菌属Verrucosispora Rheims、Jishengella Xie 10 灯台树Alstonia scholar 夹竹桃科 Apocynaceae 链霉菌属、诺卡氏菌属、红球菌属、韩国生工菌属Kribbella Park、小单孢菌属、 微球菌属Micrococcus Cohn、考克氏菌属Kocuria Stackebrandt、假诺卡氏菌属Pseudonocardia Henssen、珊瑚状放线菌属Actinocorallia Iinuma 11 沉香树Aquilaria crassna 瑞香科 Thymelaeaceae 链霉菌属、野野村氏菌属、马杜拉放线菌属Actinomadura Lechevalier et Lechevalier、假诺卡氏菌属、诺卡氏菌属 12 黄花蒿Artemisia annua 菊科 Asteraceae 链霉菌属、原小单孢菌属、假诺卡氏菌属、诺卡氏菌属、野野村氏菌属、红球菌属、韩国生工菌属、小单孢菌属、马杜拉放线菌属、链孢囊菌属Streptosporangium Couch、拟无枝菌酸菌属Amycolatopsis Lechevalier、指孢囊菌属Dactylosporangium Thiemann、芽 生球菌属Blastococcus Ahrens et Moll、糖霉菌属Glycomyces Labeda、考克氏菌属、微球菌属、戈登氏菌属Gordonia Stackebrandt、游动四孢菌属Planotetraspora Runmao、Phytomonospora Li 13 印楝Azadirachta indica 楝科 Meliaceae 链霉菌属、链孢囊菌属、小双孢菌属、轮枝链霉菌属、糖单孢菌属、诺卡氏菌属 9 喜树Camptotheca acuminate 蓝果树科 Nyssaceae 链霉菌属、假诺卡氏菌属、产孢放线菌属Actinomycetospora Jiang、糖单孢菌属、糖多孢菌属Saccharopolyspora Lacey et Goodfellow、小单孢菌属、植物生孢放线菌属Plantactinospora Qin、芽生球菌属、戈登氏菌属、冢村氏菌属Tsukamurella Collins 14 滇南美登木Maytenus austroyunnanensis 卫矛科 Celastraceae 链霉菌属、拟诺卡氏菌属、假诺卡氏菌属、小单孢菌属、糖多孢菌属、冢村氏菌属、微杆菌属Microbacterium Orla-Jensen、原小单孢菌属、分枝杆菌属Mycobacterium Lehmann et Neumann、姜氏菌属Jiangella Song、诺卡氏菌属、野野村氏菌属、马杜拉放线菌属、链孢囊菌属、拟无枝菌酸菌属、纤维菌属Cellulosimicrobium Schumann、糖霉菌属、戈登氏菌属 15 水茄Solanum torvum 茄科 Solanaceae 链霉菌属、韩国生工菌属 16 苦豆子Sophora alopecuroides 豆科 Leguminosae 链霉菌属、诺卡氏菌属、放线菌属Actinomyces Harz、小单孢菌属、游动放线菌属Actinoplanes Couch、分枝杆菌属、类诺卡氏菌属Nocardioides Prauser、孢囊放线菌属Actinosporangium Krasilnikov et Yuan、罗氏菌属Rothia Georg et Brown、钦氏菌属Chainia Thirumalachar、链孢囊菌属 17 百部Stemona tuberosa 百部科 Stemonaceae 链霉菌属、小单孢菌属、假诺卡氏菌属、甲基杆菌属Methylobacterium Patt 6 13种红树林药用植物 — 链霉菌属、小单孢菌属、糖丝菌属Saccharothrix Labeda、诺卡氏菌属、拟诺卡氏菌属、伦茨氏菌属Lentzea Yassin 18 12种热带雨林药用 植物 — 链霉菌属、假诺卡氏菌属、拟诺卡氏菌属、小单孢菌属、拟无枝菌酸菌属、诺卡氏菌属、野野村氏菌属、马杜拉放线菌属、戈登氏菌属、原小单孢菌属、分枝杆菌属、链孢囊菌属、指孢囊菌属、动孢囊菌属Kineosporia Pagani et Parenti、动球菌属Kineococcus Yokota、草状孢菌属Herbidospora Kudo、姜氏菌属、伦茨氏菌属、糖霉菌属、珊瑚状放线菌属、糖多孢菌属、迪茨氏菌属Dietzia Rainey、两面神菌属Janibacter Martin、芽生球菌属、微球菌属、植物生孢放线菌属、冢村氏菌属、小链孢菌属Catellatospora Asano et Kawamoto、微杆菌属、红球菌属、厄氏菌属、节杆菌属Arthrobacter Conn et Dimmick 4 36种泰国药用植物 — 链霉菌属、小双孢菌属、诺卡氏菌属、小单孢菌属 8 26种攀西药用植物 — 链霉菌属、厄氏菌属、野野村氏菌属、小单孢菌属、原小单孢菌属、红球菌属 5 7种四川西部药用植物 — 链霉菌属、野野村氏菌属、小单孢菌属、拟诺卡氏菌属、糖霉菌属、厄氏菌属、纤维菌属 19 80种热带雨林药用 植物 — 链霉菌属、小单孢菌属、假诺卡氏菌属、拟诺卡氏菌属、野野村氏菌属、马杜拉放线菌属 20 143种热带雨林药用 植物 — 链霉菌属、拟诺卡氏菌属、疣孢菌属、姜氏菌属、珊瑚状放线菌属、假诺卡氏菌属、小单孢菌属、糖霉菌属、戈登氏菌属 21 3种药用植物 — 链霉菌属、拟无枝菌酸菌属 22

表 1 药用植物内生放线菌的多样性 Table 1 Diversity of endophytic actinobacteria in medicinal plants

药用植物内生放线菌不仅具有丰富的物种多样性，而且还包含着大量的新分类单元，包括植物生孢放线菌属、Phytohabitans Inahashi、姜氏菌属、Allonocardiopsis Du和Phytomonospora Li等新属。陈华红^[23]从采自西双版纳热带雨林的90种药用植物中分离得到2 742株内生放线菌，16S rRNA基因序列分析结果表明，所有菌株分布在13个科的24个属，其中有14个潜在的新物种。后来，Qin等^[4]从西双版纳热带雨林采集的12种药用植物中分离得到内生放线菌2 174株，16S rRNA序列分析表明，所有菌株在属的水平上被分为32个不同类群，其中糖多孢菌属、迪茨菌属、芽球菌属、指孢囊菌属、原小单孢菌属、厄氏菌属、珊瑚放线菌属和姜氏菌属8个类群首次在植物内生环境中被描述，而且至少有19个菌株是潜在的新分类单元。显示了热带雨林地区植物内生放线菌极其丰富的多样性。李洁^[24]在研究药用植物黄花蒿内生放线菌时，发现一种小单孢菌科的一个新属，另外还分别获得假诺氏菌属、链霉菌属和野野村氏菌属的一个新种。杜慧竟等^[25]从37种药用植物中分离得到内生放线菌600余株，分属于34个属，其中有很多比较罕见的稀有放线菌类群，共发现潜在的新分类单元7个。表 2列举了近5年来发表的药用植物内生放线菌新分类单元。可以说，自然界的药用植物中有大量的内生放线菌资源有待进一步的研究发现。

表 2(Table 2)

表 2 药用植物内生放线菌新分类单元 Table 2 Novelendophytic actinobacteria isolated from medicinal plants GenBank 登录号 内生放线菌 宿主植物 近缘种（16S rRNA基因 序列相似度 / %） 文献 DQ460470 桤木链霉菌Streptomyces alni 尼泊尔桤木Alnus nepalensis 河北链霉菌Streptomyces hebeiensis（97.6） 26 DQ887489 内生假诺卡氏菌Pseudonocardia endophytica 密毛山梗菜Lobelia clavata Pseudonocardia kongjuensis（98.5） 27 EU005372 内生微球菌Micrococcus endophyticus 土沉香Aquilaria sinensis 藤黄微球菌Micrococcus luteus（99.06） 28 EU200682 甘草糖霉菌Glycomyces scopariae 野甘草Scoparia dulcis Glycomyces algeriensis（97.4） 29 EU200683 美登木链霉菌Streptomyces mayteni 滇南美登木 Streptomyces phaeopurpureus（99.5） 30 EU814511 美登木糖霉菌Glycomyces mayteni 滇南美登木 Glycomyces algeriensis（97.1） 29 EU921261 相思假诺卡氏菌Pseudonocardia acaciae 大叶相思Acacia auriculiformis Pseudonocardia spinosispora（96.2） 31 EU925562 景天链霉菌Streptomyces sedi Sedum sp. Streptomyces specialis（97.5） 32 FJ157184 Nonomuraea antimicrobica 滇南美登木 Nonomuraea candida（98.2） 33 FJ157185 Actinomadura flavalba 滇南美登木 Actinomadura atramentaria（97.4） 34 FJ157186 Jiangella alba 滇南美登木 Jiangell alkaliphila（98.8） 35 FJ214343 Plantactinospora mayteni 滇南美登木 Micromonospora. endolithica （98.1） 36 FJ214355 云南微球菌Micrococcus yunnanensis 大头茶Polyspora axillaris Micrococcus luteus（99.7） 37 FJ214356 Herbidospora osyridis 沙针Osyris wightiana Herbidospor cretacea（99.9） 38 FJ214362 Kineosporia mesophila 雷公藤Tripterygium wilfordii Kineosporia mikuniensis（98.2） 39 FJ214364 雷公藤糖多孢菌Saccharopolyspora tripterygii 昆明山海棠Tripterygium hypoglaucum 内生糖多孢菌Saccharopolyspora endophytica（98.6） 40 AB490769 Phytohabitans suffuscus 兰花 Micromonospora pattaloongensis（97.7） 41 EU005371 嘉兰糖多孢菌Saccharopolyspora gloriosae 嘉兰Gloriosa superba Saccharopolyspora gregorii（99.1） 42 EU200685 艾属链霉菌Streptomyces artemisiae 黄花蒿 Streptomyces armeniacus（99.9） 43 EU429322 相思放线异壁酸菌Actinoallomurus acaciae 大叶相思 Actinoallomurus caesius（99.3） 44 GQ906587 雨林假诺卡氏菌Pseudonocardia tropica 滇南美登木 桤木假诺卡氏菌Pseudonocardia alni（99.5） 45 EU560726 Jishengella endophytica 老鼠簕 Micromonospora olivasterospora （98.7） 46 FJ817375 版纳假诺卡氏菌Pseudonocardia bannaensis 黄花蒿 艾属假诺卡氏菌Pseudonocardia artemisiae（99.4） 47 FJ817377 昆明假诺卡氏菌Pseudonocardia kunmingensis 黄花蒿 四川假诺卡氏菌Pseudonocardia sichuanensis（99.9） 48 FJ817379 Pseudonocardia serianimatus 黄花蒿 Pseudonocardia petroleophila（98.8） 49 GU227146 艾属假诺卡氏菌Pseudonocardia artemisiae 黄花蒿 Pseudonocardia saturnea（96.6） 50 GU367156 Phytomonospora endophytica 黄花蒿 Micromonospora schwarzwaldensis（93.6） 51 GU367157 艾属诺卡氏菌Nocardia artemisiae 黄花蒿 丽江诺卡氏菌Nocardia lijiangensis（98.2） 52 GU367158 内生野野村氏菌Nonomuraea endophytica 黄花蒿 Nonomuraea candida（98.8） 53 HM153789 四川假诺卡氏菌Pseudonocardia sichuanensis 麻疯树Jatropha curcas Pseudonocardia adelaidensis（98.9） 54 HM153799 内生拟无枝菌酸菌Amycolatopsis endophytica 麻疯树 Amycolatopsis eurytherma（98.9） 55 HM153801 内生诺卡氏菌Nocardia endophytica 麻疯树 Nocardia callitridis（98.4） 56 AB668306 Actinoallomurus liliacearum 麦冬Ophiopogon japonicus Actinoallomurus luridus（99.1） 57 AB668307 Actinoallomurus vinaceus 麦冬 Actinoallomurus spadix（98.0） 57 FJ214352 Promicromonospora xylanilytica 滇南美登木 气传原小单孢菌Promicromonospora aerolata（99.4） 58 FJ817380 Pseudonocardia antimicrobica 黄花蒿 Pseudonocardia parietis （99.1） 59 GQ494033 内生植物生孢放线菌Plantactinospora endophytica 喜树 美登木植物生孢放线菌Plantactinospora mayteni（99.1） 60 GU367155 艾属红球菌Rhodococcus artemisiae 黄花蒿 Rhodococcus pyridinivorans （98.4） 61 HM153774 攀枝花类诺卡氏菌Nocardioides panzhihuaensis 麻疯树 白色类诺卡氏菌Nocardioides albus（99.38） 62 HM153787 Kibdelosporangium phytohabitans 麻疯树 Kibdelosporangium aridum subsp. aridum （98.8） 63 JQ345722 Streptomyces phytohabitans 莪术Curcuma phaeocaulis Streptomyces armeniacus（97.9） 64 JQ619535 海桑小单孢菌Micromonospora sonneratiae 无瓣海桑Sonneratia apetala Micromonospora pattaloongensis（98.3） 65 JQ819252 南通假诺卡氏菌Pseudonocardia nantongensis 怪柳Tamarix chinensis Pseudonocardia kongjuensis（98.33） 66 JQ819257 Kineococcus endophytica 补血草Limonium sinense Kineococcus rhizosphaerae（98.72） 67 GU367154 内生链霉菌Streptomyces endophyticus 黄花蒿 昆明链霉菌Streptomyces kunmingensis（98.55） 68 HM449824 Streptomyces kebangsaanensis 马齿苋Portulaca oleracea 黄麻链霉菌Streptomyces corchorusii（98.2） 69 JQ309825 Allonocardiopsis opalescens 金银忍冬Lonicera maackii Nocardiopsis arabia（93.2） 70 JQ819253 江苏拟无枝菌酸菌Amycolatopsis jiangsuensis 野菊Dendranthema indicum Amycolatopsis sulphurea（97.96） 71 JQ819258 Modestobacter roseus 盐角草Salicornia europaea Modestobacter marinus（99.5） 72 JQ819259 Streptomyces halophytocola 怪柳 Streptomyces sulphureus（99.43） 73 JQ819260 菊花糖多孢菌Saccharopolyspora dendranthemae 野菊 Saccharopolyspora pathumthaniensis（99.31） 74 KC806052 内生罗氏菌Rothia endophytica 水虎尾Dysophylla stellate Rothia nasimurium（98.5） 75

表 2 药用植物内生放线菌新分类单元 Table 2 Novelendophytic actinobacteria isolated from medicinal plants

2 内生放线菌次生代谢产物相关合成基因的多样性

放线菌是天然活性物质，尤其是天然药物的重要来源^[2]。由于微生物多样性十分丰富，代谢产物多种多样，如何筛选获得新的活性代谢产物，已成为微生物天然药物研究中亟需解决的重要问题之一。为了解决这个问题，研究者对代表性放线菌进行基因组序列分析，发现了放线菌的次生代谢产物合成基因的多样性，于是建立起了基于序列相似性指导的基因筛选技术，成为研究天然产物生物合成的新途径。基因筛选（sequence-guided genetic screening）是指将特定基因作为筛选标记，在基因水平上评估微生物产生某种代谢物的可能性及其产生生物活性物质的潜力。在放线菌次生代谢产物基因筛选的研究中，聚酮合酶（polyketide synthnase，PKS）基因、非核糖体多肽合成酶（non-ribosomal peptide synthnase，NRPS）基因这2种功能基因被作为主要的筛选标记^[4,5,6]。其中PKS主要又包括PKS I和PKS II 2种类型。另外，卤化酶基因^[6]、安莎类抗生素3,5-AHBA合成酶基因（rifK）^[16]、糖肽类抗生素合成关键酶P450单加氧酶基因（oxyB）^[16]等也用于天然代谢产物的基因标记中。

目前，次生代谢产物合成基因筛选作为一种发现新药先导化合物的方法已被广泛应用，对药用植物内生放线菌功能基因的研究也已有相关报道。Zhao等^[5]对攀西地区药用植物内生放线菌功能基因的研究发现，在60株实验菌株中有56株菌至少有1个基因被检出，PKS I、PKS II、NRPS基因的检出率分别为53%、82%、53%，但功能基因的检出与抑菌活性之间的相关性并非一一对应。冯治翔等^[16]对14株来自连翘和水茄的内生放线菌进行5类生物合成关键酶基因筛选分析，结果显示PKS I、PKS II、NRPS、rifK、oxyB的检出率分别为43%、93%、86%、29%、7%。朱文勇等^[14]对喜树内生放线菌功能基因的筛选结果显示，PKS I、PKS II、NRPS基因的检出率分别为31%、49%、46%。Li等^[76]对41株药用植物内生链霉菌的PKS和NRPS基因进行扩增，结果发现PKS I、PKS II、NRPS基因的检出率分别为34%、63%、61%。Qin等^[4]对西双版纳药用植物内生稀有放线菌PKS/NRPS基因进行筛选结果发现，PKS I、PKS II、NRPS基因的检出率分别仅为11%、15%、26%，远远低于内生链霉菌的比例。对分离自百部的18株内生链霉菌的次生代谢潜力进行评估，结果显示PKS I、PKS II、NRPS基因的阳性检出率分别为67%、28%、61%，44%的菌株具有卤化酶基因，对同时具有PKS/NRPS和卤化酶基因的代表菌株进行发酵产物分析，结果显示与基因筛选具有较好的一致性^[6]。李芳等^[77]基于化学遗传学从滑桃Trewia nudiflora L. 中筛选出一株具有合成萘醌类化合物关键基因的内生链霉菌（Streptomyces sp. HTZ27），经固体发酵、化合物分离纯化、鉴定后，发现该菌发酵产物中有呋喃萘醌I，得率接近5 mg/L。

基因筛选因其简单可行，已被广泛应用于内生放线菌的研究中。但值得注意的是，天然产物合成相关基因与菌株的抗菌活性之间并不一定存在必然联系，有的菌株虽然能检测出功能基因，但并不表现出任何抗菌活性；而有的菌株虽未扩增出任何功能基因，但却表现出抑菌活性^[5]。因此，将天然活性物质的基因筛选与抗菌活性实验相结合，这样筛选得到的菌株产生活性化合物的可能性更大，同时也可以很好地避免活性菌株的漏筛。

研究表明，从植物内生菌分离的51%生物活性物质是以前没有发现的，而从土壤微生物分离的新物质仅为38%^[78]，显示了植物内生菌巨大的开发潜力。与植物内生真菌研究相比，植物内生放线菌因其生长缓慢、分离困难而研究相对较少^[79]。但近年来发展迅速，发现了抗生素以及具有抗肿瘤作用等一批具有应用潜力的新活性物质^[1]，有望应用于医药和农业生产中。

Castillo等^[80]从澳大利亚的一种药用植物蛇藤Kennedia nigriscans中分离到一株链霉菌（Streptomyces sp. NRRL30562），它能产生一类含有Thr、Asp（或Asn、Gin）等氨基酸的多肽化合物munumbicin A～D。该化合物为一类具有广谱抗菌活性的抗生素，对革兰阳性细菌如炭疽芽孢杆菌Bacillus anthracis Cohn和许多耐药性细菌如结核分枝杆菌Mycobacteriumtuberculosis Lehmann et Neumann等都具有强烈的抑菌活性。Munumbicin D对疟原虫Plasmodium flciparum也具有较强的杀灭作用。后来，又从该放线菌中分离到2个多肽类抗生素munumbicin E-4和E-5，也同munumbicin A～D一样具有广谱抗菌活性，对疟原虫有强杀伤活性，IC₅₀分别为0.42～0.58 μg/mL和0.85～0.87 μg/mL^[81]。从分离自银桦Grevillea pteridifolia的内生放线菌（Streptomyces sp. NRRL 30566）中得到的kakadumycin也是一种多肽抗生素，对革兰阳性细菌具有很强的抗菌活性，同时其对RNA合成酶也表现出抑制活性^[82]。Coronamycins是Ezra等^[83]从内生放线菌（Streptomyces sp. MSU-2110）中分离到的一种新的多肽类化合物，该化合物对疟原虫有很强的抑制作用，IC₅₀达到9.0 ng/mL。

Zhao等^[84]从美登木Maytenus hookeri Loes. 内生放线菌（Streptomyces sp. Is9131）中分离到dimeric nonactin和dimeric dinactin，属于大环内酯类化合物，有比较强的抗菌和抗肿瘤活性。另一株美登木内生菌（Streptomyces sp. CS）能产生具有抗真菌和抗肿瘤活性的十六元大环内酯24-demethyl- bafilomycin C1及其衍生物24-demethyl-bafilomycin A2^[85,86]，24-demethyl-bafilomycin A2对肿瘤细胞株A-549和P388的IC₅₀分别达到0.01和1.13 μmol/L。Li等^[87]又从该内生放线菌中分离得到5种大环内酯类新化合物，细胞毒性测试结果显示5种化合物对离体MDA-MB-435细胞具有抑制作用，IC₅₀分别为4.2、4.5、5.5、3.8和11.4 μmol/L。从滑桃内生放线菌（Streptomyces sp. A2）中分离得到1种大环内酯化合物macrotetrolide，对革兰阳性细菌有较好的活性，对革兰阴性细菌和真菌几乎没有活性^[88]。

Kim等^[89]从蓖麻Ricinus communis L. 内生放线菌（Streptomyces laceyi MS53）中分离得到2种新的6-alkylsalicylic acid，分别为salaceyin A、B，细胞毒性检测显示它们对人类乳腺癌细胞SKBR3具有较强抑制作用，IC₅₀分别达到3.0和5.5 μg/mL。由植物内生菌（Streptomyces hygroscopicus S-17）产生的pteridic acid A、B，有类似植物激素的作用，在1 nmol/L浓度时能够促进植物根系的形成^[90]。

生物碱类化合物广泛存在于植物体中，其中很多具有抗肿瘤活性，并且已经应用于临床。如美登木素生物碱（maytansinoid），主要来源于卫矛科美登木属植物，具有很强的抗肿瘤活性。从内生放线菌Actinosynnema pretiosum Hasegawa中分离到maytansinoid，但与植物来源的美登木素化合物不同，在大环上的C-3位侧链酯基结构相对较简单^[88]。另外，从内生菌株（Streptomyces sp. TP-A0595）中分离到1个简单的生物碱类化合物6-prenylindole，该化合物对植物病原菌Fusarium oxysporum Schl. 具有显著的抗真菌活性^[91]。

紫杉醇（taxol）是一种二萜衍生物，可以抑制微管解聚和稳定微管，进而影响有丝分裂，对多种癌症如卵巢癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、膀胱癌、肺癌以及风湿性关节炎等具有良好的治疗效果。1993年，Stierle等^[92]首次从短叶紫杉Taxus brevifolia Nutt.中分离出一株能产紫杉醇和其他紫杉烷类物质的内生真菌安德紫杉菌Taxomyces andreanae。这一发现为利用微生物发酵生产紫杉醇，以解决紫杉醇药源危机提供了一条新途径，并且掀起了从药用植物中分离内生菌的热潮。随后，Caruso等^[93]从欧洲红豆杉Taxus baccata L. 中分离得到一些能够产生紫杉烷类物质内生放线菌菌株，它们分别属于北里孢菌属Kitasatospora Ōmura、小单孢菌属和链霉菌属，其中一株北里孢菌具有paclitaxel的全部合成途径。这是首次有关从内生放线菌中分离到紫杉醇类似物的报道。之后仅有少数关于红豆杉内生放线菌的报道^[22]。

Bieber等^[94]从欧洲桤木Alnus glutinosa (L.) Gaertn. 中分离到一株链霉菌，从其代谢产物中发现一种新的萘醌类抗生素alnumycin，它对革兰阳性病原菌具有抑制作用。李芳等^[77]从滑桃内生链霉菌（Streptomyces sp. HTZ27）中分离得到呋喃萘醌I，得率接近5 mg/L。Igarashi等^[95]从一株内生放线菌新种Micromonospora lupini 发酵产物中分离得到2个新的蒽醌类化合物lupinacidin A、B，该化合物显示了很好的抗肿瘤活性，对小鼠结肠癌细胞26-L5生长具有很好的抑制效果。

香豆素属于苯丙素类化合物，广泛存在于植物体内，具有调节植物生长、抗癌、抗菌、抗凝血等生理活性，目前从自然界中已经发现了900余种香豆素类化合物。Igarashi^[91]从青木Aucuba japonica Thunb. 内生放线菌（Streptomyces sp. TP-A0556）中分离得到1种香豆素类物质demethylnovobiocin，抗菌活性研究表明，该物质抗菌活性较新生霉素相对较弱。

Pullen等^[96]从卫矛科植物中分离到1株桑氏链霉菌Streptomyces sampsonii Waksman能产生1种新的抗生素chloropyrrol，对多种耐药性细菌和分枝杆菌有很强的抑制作用。鲁春华等^[97]发现1株云南美登木内生菌（Streptomyces sp. CS）可产生具有抗肿瘤、抗白血病和抗菌活性的新多羟基环己烷衍生物。从植物内生菌中分离到的cedarmycin A和B，属于丁内酯类化合物，对革兰阳性细菌、革兰阴性细菌和酵母都有一定的活性，对Candida glabrata IFO 0622的MIC为0.4 μg/mL，与阳性对照两性霉素B的活性相当^[91]。

药用植物内生放线菌的研究极大地扩大了微生物资源的范围，其丰富的代谢物质为微生物制药提供了新的途径。但也必须看到，药用植物内生放线菌代谢产物离规模化的工业生产还有相当大的距离。最关键的问题就是要找到具有生物活性物质高产菌株。在此基础上进一步探索发酵条件，优化生产工艺，为活性物质产生菌的工业化发酵奠定基础。

相比内生真菌，药用植物内生放线菌生长缓慢，菌株的分离纯化更困难，容易受到其他微生物污染。另外，对内生放线菌的生理学研究欠缺，培养条件也不清楚，这些都加大了其研究的难度。因此，研究植物内生放线菌生理学特性，进一步探索内生放线菌的分离培养方法，分离到更多的微生物菌种资源，并在此基础上研究其代谢活性物质，将成为未来研究的重点。

大量的研究表明，药用植物内生放线菌作为重要的微生物资源，其代谢活性物质具有抗菌、抗肿瘤、抗病毒等活性，在工业生产特别是生物制药中表现出潜在的应用前景，对药用植物内生放线菌及其代谢产物的研究已经成为当前的一个热点领域。