2020/5/1 22:01:55 58true 目的 采用网络药理学与分子对接法探索疏风解毒胶囊治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的潜在作用机制与活性成分。方法 借助TCMSP数据库检索疏风解毒胶囊组成药材板蓝根、虎杖、连翘、芦根、败酱草、马鞭草、柴胡、甘草的化学成分和作用靶点，通过Swiss Target Prediction数据库剔除可能性为0的靶点。以“冠状病毒（coronavirus）”“肺炎（pneumonia）”“咳嗽（cough）”“发热（fever）”为检索词在GeneCards及OMIM数据库中检索疾病相应靶点。通过Uniprot数据库校正靶点名称，取疏风解毒胶囊与疾病靶点交集，进而运用Cytoscape 3.7.2软件构建中药-化合物-靶点网络进行可视化，通过DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析，预测交集靶点作用机制，并绘制柱状图及气泡图进行可视化。然后将所有化合物与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶进行对接，选取结合能最小的前5个化合物与血管紧张素转化酶II（ACE2）进行对接。结果 中药-化合物-靶点网络包含了8种中药，157个化合物和相应靶点260个，关键靶点涉及PTGS2、ESR1、AR等。GO功能富集分析得到条目393个（P<0.05），KEGG通路富集分析筛选得到139条信号通路。分子对接结果显示6-（3-氧吲哚-2-亚立德）吲哚[2，1-b]喹唑啉-12-酮、荷包牡丹碱、大黄素甲醚葡萄糖苷、双氢轮叶十齿草碱和甘草异黄烷酮5个核心化合物与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2的结合能较推荐化学药小。结论 疏风解毒胶囊中的化合物能通过与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2结合作用于PTGS2、ESR1、AR等靶点调节人巨细胞病毒感染、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、IL-17信号通路等信号通路、小细胞肺癌等发挥治疗COVID-19作用。]]> 2020/5/1 22:01:55 57true 目的 筛选藿朴夏苓汤治疗早期新型冠状病毒肺炎（COVID-19）湿邪郁肺证的物质基础，预测其作用机制。方法 查阅文献及临床报道分析藿朴夏苓汤与早期COVID-19湿邪郁肺证的方证关系。运用TCMSP数据库筛选藿朴夏苓汤中潜在活性成分，将活性成分与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶、血管紧张素转化酶II（ACE2）进行分子对接，根据结合能筛选与两者均有较好结合作用的核心成分。借助Cytoscape软件构建关键成分靶点蛋白互作网络，筛选出核心靶点；通过STRING数据库进行核心靶点的GO分析，Cytoscape软件ClueGO插件进行Pathway、KEGG富集分析。结果 方证关系分析藿朴夏苓汤用于治疗早期COVID-19湿邪郁肺证，筛选出藿朴夏苓汤中潜在作用成分12个，核心靶点67个。其中通草中的通脱木皂苷元I，茯苓、猪苓中的过氧麦角甾醇，半夏中的黄芩苷与SARS-CoV-2 3CL水解酶、ACE2均具有较好的结合活性。GO、Pathway、KEGG富集分析结果显示藿朴夏苓汤中12个潜在作用成分参与调节刺激反应、信号转导、细胞死亡等生物过程以及白介素信号通路、癌症EGFR信号通路、酪氨酸激酶信号转导途径、编程性细胞死亡途径、MAPK信号通路等。结论 藿朴夏苓汤以化湿解毒、宣肺透邪治疗早期COVID-19湿邪郁肺证患者，菲酮、黄芩苷、酸枣仁皂苷、啤酒甾醇、常春藤皂苷元、过氧麦角甾醇、柠檬二烯醇、麦角甾-7，22-二烯-3-酮、通脱木皂苷元I、泽泻醇B-23-醋酸酯、泽泻醇B、新橙皮苷可能为其主要的物质基础，通过阻断SARS-CoV-2病毒蛋白合成，阻止病毒进入宿主细胞，通过调控白介素信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、T细胞受体信号通路、C型凝集素受体信号通路，抑制相关炎症因子的表达发挥作用。]]> 2020/5/1 22:01:55 56true 目的 探索补肺活血胶囊用于新型冠状病毒肺炎（COVID-19）恢复期治疗的潜在作用机制，为其临床用药提供理论指导。方法 通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）、BATMAN-TCM、中国知网（CNKI）和Pubmed数据库获得补肺活血胶囊的活性成分及作用靶点；通过GeneCards数据库获取COVID-19相关靶点，并采用交集法筛选出与补肺活血胶囊活性组分作用的共同靶点，运用Cytoscape 3.7.2构建“中药-化合物-靶点”网络，并通过String数据库构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络；通过DAVID数据库进行KEGG通路和GO功能富集分析，并运用R version 3.6.3软件将结果进行可视化；采用AutoDock Tools 1.5.6、AutoDock vina 1.1.2进行分子对接研究。结果 从补肺活血胶囊中共筛选出潜在活性成分32个，对应靶点203个，核心化合物11个，核心靶点52个；PPI网络分析获得补肺活血胶囊干预COVID-19关键作用靶点25个；GO及KEGG富集分析得出与补肺活血胶囊治疗COVID-19作用相关的生物过程251个（P<0.05），相关信号通路93条（P<0.05）；分子对接结果显示补肺活血胶囊核心化合物与新型冠状病毒（SARS-CoV-2） 3CL水解酶和血管紧张素转化酶II（ACE2）具有较好的亲和。结论 补肺活血胶囊含有的核心化合物可作用于IL6、MAPK8、PTGS2、PTGS1、NCOA2等靶点，调节多条信号通路，从而发挥对COVID-19恢复期的治疗作用。]]> 2020/5/1 22:01:55 55true 目的 采用网络药理学和分子对接法分析款冬花在清肺排毒汤治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）中发挥的作用。方法 基于课题组前期研究，确定款冬花中的主要成分。采用Swiss Target Prediction和BATMAN-TCM数据库对款冬花主要化学成分的潜在靶点进行整理；在GenCLiP 3和GeneCard数据库搜索COVID-19相关靶点，运用Cytoscape 3.7.1软件绘制款冬花成分-靶点-疾病网络图；使用String数据库构建靶点PPI网络；通过DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路富集分析；将各成分与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶和血管紧张素转化酶II（ACE2）进行分子对接。结果 款冬花治疗COVID-19的化合物-靶点-疾病网络包含化合物14个、靶点104个、疾病4个。GO功能富集分析得到GO条目444个（P<0.05），其中包括生物过程（BP）条目325个、细胞组成（CC）条目44个、分子功能（MF）条目75个。KEGG通路富集筛选得到94条信号通路（P<0.05）。分子对接结果显示异绿原酸B（3，4-dicaffeoylquinic acid）和异绿原酸C（4，5-dicaffeoylquinic acid）与蛋白的亲和力要优于瑞德西韦。结论 款冬花中主要化合物能通过与SARS-CoV-2 3CL水解酶和ACE2结合，作用于多靶点调节多条信号通路，从而发挥对COVID-19的防治作用。]]> 2020/5/1 22:01:56 54true 目的 通过网络药理学及分子对接技术预测金振口服液（Jinzhen Oral Liquid，JOL）干预新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制。方法 通过文献挖掘以及DisGeNET、OMIM、KEGG、UniProt数据库联用检索与COVID-19相关的蛋白靶点。借助Traditional Chinese Medicine Network（TCMN）信息平台检索JOL中的化合物，运用Cytoscape 3.2.1构建药材-化合物-靶点网络来预测JOL治疗COVID-19的活性成分及作用靶点。在RCSB PDB数据库中检索获取新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶（3CLpro）和血管紧张素转化酶II（ACE2）的晶体结构，借助AutoDock Vina软件将活性化合物与2个蛋白进行分子对接。结果 药材-化合物-靶点网络包含异甘草酸内酯、贝母辛、番泻苷B等75个化合物分别来自甘草、大黄和平贝母3味药材，哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mTOR）、Janus激酶3（JAK3）、丝裂原活化蛋白激酶激酶1（MEK1）等28个靶点。网络特征分析阐明了JOL治疗COVID-19的9个关键化合物（异甘草酸内酯、甘草内酯、去氢鄂贝定碱、desoxo-glabrolid-acetate、贝母辛、贝母素乙、乌苏里啶酮、西贝素和euchrenone A5）以及10个潜在作用靶（mTOR、JAK3、ACE2、TNFA、AKT2、PIK3CA、MEK1、BRD2、ACE、ANPEP）。分子对接显示，JOL中部分活性化合物对3CLpro和ACE2蛋白具有一定的亲和力。结论 JOL可能是通过调节溴结构域包含蛋白2（Brd2）、氨肽酶N（CD13）和ACE2的表达以及干预PI3K/Akt、Jak-STAT、TNF和MAPK信号通路来遏制COVID-19细胞因子风暴的发生和发展，并与3CLpro结合抑制病毒复制，从而有可能对COVID-19有防治作用。]]> 2020/5/1 22:01:56 53true 目的 利用网络药理学方法解析参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）合并冠心病的分子网络作用途径。方法 借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）和中医百科全书平台（ETCM）收集参麦注射液中红参、麦冬的化学成分；通过SwissTargetPrediction数据库预测化合物的作用靶点；通过NCBI数据库和GeneCards数据库筛选COVID-19及合并症冠心病的靶点；通过DAVID数据库分别进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析；运用Cytoscape 3.7.1软件构建化合物-靶点-通路网络。利用Glide软件对参麦注射液成分与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶（Mpro）的分子对接。结果 参麦注射液中麦冬皂苷D'、麦冬皂苷D、人参皂苷Rg₂、麦冬甲基黄烷酮A、麦冬苷元-3-O-新橙皮糖苷、人参皂苷Rb₂、人参皂苷R₀、Ophiopogon A、三七皂苷Rd、麦冬二氢高异黄酮E、人参皂苷Re在分析中显示了较高的度值，且与SARS-CoV-2 3CL水解酶结合力较强，可能是参麦注射液发挥治疗COVID-19合并冠心病的主要药效成分，共涉及到IL6、GAPDH、ALB、TNF、MAPK1、MAPK3、TP53、EGFR、CASP3、CXCL8等77个靶点，以及低氧诱导因子-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、鞘脂信号通路、Toll样受体信号通路、神经营养素信号通路、血管内皮生长因子信号通路、细胞凋亡、Ras信号通路、PI3K-Akt信号通路、泌乳素信号通路等124条信号通路。结论 参麦注射液可能通过抑制细胞因子风暴、维持心脏功能稳态、调节免疫、抗病毒等方面实现对COVID-19与冠心病的同时干预，呈现出了相互影响、复杂关联的网络调控机制。]]> 2020/5/1 22:01:56 52true 目的 通过网络药理学及分子对接法探讨三仁汤主要成分对新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）及中医整合药理学研究平台V2.0（TCMIP V2.0）获得三仁汤君药（苦杏仁、白蔻仁、薏苡仁）全部化学成分并筛选，结合相关文献筛得主要活性成分。借助UniPort数据库查询活性成分对应靶标蛋白，Cytoscape 3.7.2构建成分-靶点网络。通过STRING网站构建PPI蛋白互作网络，运用cytoHubba分析关键子网络。CTD数据库对三仁汤君药活性成分靶蛋白进行GO、KEGG富集分析。以三仁汤君药活性成分及洛匹那韦等相关化学药物为配体，通过CB-Dock网站分别与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶进行分子对接。结果 三仁汤君药共有39个活性成分，对应有效靶标168个。GO功能富集分析筛得生物学过程（BP）、细胞组成（CC）、分子功能（MF）分别为25条、14条及2条。KEGG富集筛得先天免疫系统（innate immune system）、免疫系统中的细胞因子信号转导（cytokine signaling in immune system）及白介素信号通路（signaling by interleukins）等信号通路，共36条。分子对接提示三仁汤君药活性成分白桦脂酸、枣素及齐墩果酸与SARS-CoV-2 3CL水解酶结合性较好，三者的Vina得分与3CLpro抑制剂洛匹那韦及RdRp抑制剂瑞德西韦的得分相近。结论 三仁汤君药可能通过调控炎症因子，参与炎症相关信号通路，以多成分、多靶点、多途径参与COVID-19的多种生理过程，对治疗COVID-19发挥一定的干预作用，且其活性成分具有潜在抗SARS-CoV-2的可能性。]]> 2020/5/1 22:01:56 51true 目的 基于网络药理学的方法探索银翘解毒软胶囊治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制。方法 将银翘解毒软胶囊所含1 418个化合物与48个COVID-19炎症相关靶蛋白进行分子对接，构建药物-靶蛋白网络，阐明银翘解毒软胶囊的关键活性成分和潜在作用靶点。结果 通过网络分析获得银翘解毒软胶囊的活性成分有50个，主要为黄酮类和三萜类化合物；潜在作用靶点37个，主要为MTOR、JAK3、ACE、ACE2、PIK3CA、TNF、AKT2和MAP2K1等炎症靶点。分子对接结果显示连翘酯苷及牡荆素-2″-O-鼠李糖苷与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶具有较好的亲和力，甘草酸与血管紧张素转化酶II（ACE2）具有较好的亲和力。结论 银翘解毒软胶囊通过干扰SARS-CoV-2病毒复制、调节炎症信号通路表达及炎症因子分泌发挥治疗COVID-19作用。]]> 2020/5/1 22:01:56 50true 目的 采用分子对接技术筛选新型冠状病毒S蛋白与血管紧张素转化酶2（ACE2）小分子抑制剂。方法 化合物库采用Selleck中国天然产物库（目录号L1400，2 054种天然产物）。新型冠状病毒S蛋白与ACE2蛋白共晶采用周强研究员课题组发表结果（PDB：6M17）。采用Discovery Studio软件进行分子对接。结果 通过虚拟氨基酸突变实验确定了关键氨基酸，并在此基础上确定了结合空腔，进而从天然化合物库中筛选出11个具有潜在抑制新型冠状病毒S蛋白与ACE2作用的化合物：毛地黄皂苷、灰毡毛忍冬皂苷甲、连翘酯苷B、灰毡毛忍冬皂苷乙、川续断皂苷乙、常春藤苷D、桔梗皂苷D、松果菊苷、人参皂苷Rb₂、人参皂苷Rc、异绿原酸C。结论 从天然产物库中筛选出潜在的新型冠状病毒S蛋白-ACE2小分子抑制剂，为抗新型冠状病毒（SARS-CoV-2）药物研究及处方筛选提供参考。]]> 2020/5/1 22:01:56 49true 目的 探讨化橘红防治新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的前景，为化橘红的临床应用提供依据。方法 通过文献查阅，对化橘红及其主要化学成分在祛痰、抗急性肺损伤、抗炎、抗肺纤维化、镇咳、抗氧化、抗肝损伤和抗肾损伤等方面的药理作用进行分析，并通过中药系统药理学平台（TCMSP）和查阅文献检索化橘红的化学成分，将各化学成分与血管紧张素转化酶II（ACE2）、3CL水解酶（Mpro）、木瓜样蛋白酶（PLP）和树突状细胞特异性细胞间黏附分子-3结合非整合素因子（DC-SIGN）进行分子对接，预测其在抑制新型冠状病毒（SARS-CoV-2）病毒感染和复制方面的潜在活性。结果 文献分析结果表明，化橘红及其主要化学成分具有祛痰、抗急性肺损伤、抗炎、抗肺纤维化、镇咳、抗氧化、抗肝损伤和抗肾损伤等多方面药理活性；分子对接结果表明，柚皮苷（naringin）、新橙皮苷（neohesperdin）、野漆树苷（rhoifolin）、枸橘苷（poncirin）和西托糖苷（sitogluside）与ACE2、MPro、PLP和DC-SIGN均具有较强的结合力，具有抑制SARS-CoV-2病毒感染宿主细胞和自我复制的潜在活性。结论 化橘红既具有通过多种药理活性改善COVID-19病程进程的潜力，又可能通过作用于ACE2、MPro、PLP和DC-SIGN发挥抑制病毒感染宿主细胞及自我复制的作用。提示化橘红可能对COVID-19的防治具有积极作用。]]> 2020/5/1 22:01:56 48true 2020/5/1 22:01:56 47true 2020/4/19 10:52:23 46true 目的 通过对清肺排毒汤功效和新型冠状病毒肺炎（COVID-19）病机的分析，基于计算机辅助药物设计（CADD）从多靶点结构出发系统探索清肺排毒汤排毒、抑制炎症风暴、利水渗湿3个方面的物质基础和分子机制。方法 TCMSP下载清肺排毒汤成分，基于血管紧张素转化酶II（ACE2）、白细胞介素-6受体（IL-6R）和水通道蛋白（AQP）分别进行分子对接虚拟筛选并对其结合模式进行分析。对利水药白术、茯苓、猪苓、泽泻进行反向靶点预测和GO分析和KEGG通路富集分析，预测其作用机制。结果 阻断病毒作用最突出的前3位中药为甘草、麻黄、枳实，抑制炎症作用最突出的前3位中药是甘草、柴胡、紫菀；清肺排毒汤4个子方中，小柴胡汤阻断病毒、抑制炎症风暴的潜在活性化合物数均排第1。槲皮素及其衍生物对ACE2和IL-6R 2个靶点均具有较强结合能力，是潜在的双靶点活性化合物。ACE2的Lys 353残基是化合物与ACE2结合的关键位点。白术、茯苓、猪苓、泽泻缺乏阻断病毒、抑制炎症风暴的化合物，分子对接结果显示，这4味药材中含有的东莨菪内酯、去氢齿孔酸、α-D-半乳糖、环氧泽泻烯具有与水通道蛋白4（AQP4）的潜在结合能力。结论 清肺排毒汤可通过多种化合物分别与ACE2、IL-6R、AQP4结合，发挥排毒、抑制炎症风暴、利水渗湿的作用；各组成子医方配伍合理，通过多点协同、优势互补发挥防治作用；得到了中药阻断新型冠状病毒（SARS-CoV-2）成分关键的结合位点Lys 353，为清肺排毒汤药效机制的多角度挖掘和单体成分的现代化开发提供线索。]]> 2020/4/19 10:52:23 45true 目的 通过网络药理学探讨麻杏石甘汤治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用靶点及信号通路，阐述其可能的作用机制。方法 从TCMSP和TCMID数据库搜索麻杏石甘汤4味中药的活性成分及靶点，使用GeneCards及NCBI数据库获取COVID-19靶点；通过STRING数据库构建蛋白质相互作用（PPI）网络。利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-化合物-作用靶点-疾病网络，使用Bioconductor生物信息软件包进行GO功能富集和KEGG通路分析。结果 从麻杏石甘汤4味药材中筛选获得127个化合物和相应靶点237个。将麻杏石甘汤主要活性成分调控的靶点与COVID-19的治疗靶点取交集，得到49个关键靶点。GO功能富集分析得到GO条目155个（P<0.01），KEGG通路富集分析筛选得到90条信号通路（P<0.01）。构建药物-化合物-作用靶点-疾病网络，显示槲皮素、山柰酚、柚皮素、木犀草素等活性化合物在整个网络中发挥着关键作用。结论 麻杏石甘汤作用于COVID-19的PPI网络中IL-6、TNF、MAPK8、MAPK3、CASP3、TP53、IL-10、CXCL8、MAPK1、CCL2、IL-1β、IL-4、PTGS2等靶点起着关键作用，其中IL-6目前是COVID-19诊疗方案临床重症预警指标。这些靶点共同参与调节糖尿病并发症AGE-RAGE、IL-17和TNF等多条信号通路，发挥抗炎、抗病毒、免疫调节等作用，可能是麻杏石甘汤治疗新冠肺炎的潜在机制。]]> 2020/4/19 10:52:23 44true 目的 采用网络药理学方法从“湿邪”角度探讨中医药治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制。方法 用Cytoscape软件构建《新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第七版）》中治疗COVID-19轻型和普通型阶段4个方剂寒湿郁肺方、湿热蕴肺方、寒湿阻肺方、湿毒郁肺方的“方剂-中药”网络；利用TCMSP数据库预测筛选相关中药的有效活性成分并分别整理出每个方剂的成分；借助OmicShare平台绘制4个方剂成分的韦恩图；在Swiss Target Prediction平台预测各方剂共有成分的靶点，并在GeneCards数据库获取COVID-19相关靶点，将二者绘制为韦恩图，筛选出共有靶点；用STRING平台分析共有靶点和血管紧张素转化酶II（ACE2）的蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络；用DAVID数据库对共有靶点进行KEGG通路和GO富集分析，以及所有预测靶点与HIV病毒蛋白的相互作用分析；通过OmicShare平台和Cytoscape软件对结果进行可视化处理。结果 筛选出4个方剂的22个共有成分，预测到的268个靶点中有31个与COVID-19相关，其中3个靶点与ACE2有直接的相互作用，有129个靶点与4个HIV蛋白存在相互作用，通过KEGG通路和GO富集分析，分别筛选出87条通路和141条条目。结论 确定了治疗COVID-19 4个方剂的共有成分与湿邪的联系；推断中医药从“湿邪”治疗COVID-19的作用机制可能包括抗病毒、抗炎症、调控免疫系统、负向调节宿主细胞凋亡、消血栓、修复肺部损伤等；2-羟基异氧丙基-3-羟基-7-异戊烯-2，3-二氢苯并呋喃-5-羧酸具有较大的潜在抗疫活性。]]> 2020/4/19 10:52:24 43true 目的 探讨疏风解毒胶囊治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的分子机制。方法 借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索疏风解毒胶囊有效活性成分及作用靶点。运用GeneGards等数据库对疾病靶点进行筛选，使用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-靶点网络和蛋白互作（PPI）网络，通过DAVID数据库对靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。结果 共得到疏风解毒胶囊有效活性成分共207个，其中作用于COVID-19的60个活性成分可通过46个潜在靶标作用于COVID-19。富集得到GO中1 343个生物过程条目和6条KEGG通路，涉及内分泌抵抗、MAPK信号通路、精氨酸生物合成路径等。结论 疏风解毒胶囊主要通过黄酮类和植物甾醇类活性成分调节IL6、IL1B、CCL2、MAPK8、MAPK1、MAPK14、CASP3、FOS、ALB等关键靶点，调控炎症反应、氧化应激损伤、细胞凋亡、肺纤维化增生等过程减轻肺损伤来治疗COVID-19。]]> 2020/4/19 10:52:24 42true 目的 采用文献挖掘与分子对接技术相结合的方法筛选瑶药“十八钻”中潜在的抗新型冠状病毒（SARS-CoV-2）活性成分及寻找潜在的治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的瑶药。方法 依据瑶医传统用法及临床实践以瑶药“十八钻”为候选药物，通过文献挖掘与TCMSP、ETCM、TCMID、NPASS数据库搜集整理瑶药“十八钻”的化学成分。将搜集到的成分分别与SARS-CoV-2 3CL水解酶（Mpro）及血管紧张素转化酶2（ACE2）进行分子对接。收集两者对接得分值排名前50的成分构建中药-成分-靶点网络图，以优选活性成分，推测关键瑶药。结果 通过文献挖掘与中药数据库搜集共得到902个化学成分，通过分子对接得到与Mpro结合较好的成分219个，与ACE2结合较好的成分448个，其中槲皮素-3-O-α-L-呋喃阿拉伯糖苷、山柰酚-3-O-α-D-吡喃阿拉伯糖苷、鞣酸、胭脂虫酸、绿原酸、芦丁、西阿尼醇等成分对SARS-CoV-2具有潜在的抑制作用，关键的活性成分主要来源于双钩钻、槟榔钻、大钻、地钻、白钻、小红钻、小钻、九龙钻、四方钻等瑶药。结论 从瑶药“十八钻”中筛选出潜在的抗SARS-CoV-2中药单体，为寻找Mpro和ACE2的中药小分子抑制剂以及推测潜在抗COVID-19中药提供参考。]]> 2020/4/19 10:52:24 41true 目的 旨在开展国家卫生健康委员会和国家中医药管理局推荐治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的协定通用处方清肺排毒汤的主要化学成分及小鼠组织分布研究，为其药效物质研究提供参考依据。方法 采用UHPLC-Q-Orbitrap HRMS对清肺排毒汤的主要化学成分进行分析，色谱分离采用Acquity UPLC^® BEH C₁₈色谱柱（100 mm×2.1 mm，1.7 μm），流动相为甲醇-0.1%甲酸水，梯度洗脱，体积流量0.3 mL/min。基于化合物的一级、二级质谱信息，结合对照品比对确认，实现复方主要化学成分的快速、精准识别。在此基础上，对小鼠ig清肺排毒汤后血及组织中的移行成分进行了鉴定，并建立了同步测定麻黄碱、伪麻黄碱、苦杏仁苷、野黑樱苷、甘草苷、金丝桃苷、橙皮苷、黄芩苷、次野鸢尾黄素的定量分析方法，对小鼠ig清肺排毒汤后上述9种入血成分的组织分布进行研究。结果 从清肺排毒汤中共鉴定出39种化学成分，ig给药后，在小鼠血清、心、肝、脾、肺、肾中分别鉴定出12、9、9、8、10、10种化学成分。发现9种化学成分可快速吸收并分布到多个组织，在0.5 h时血清及各组织中除黄芩苷之外的8种化学成分的含量均达到峰值，黄芩苷含量峰值出现在2 h或4 h。重点关注的肺组织中0.5 h时各成分的暴露量依次为麻黄碱（2 759.11±784.39）ng/g > 野黑樱苷（1 819.7±427.28）ng/g > 伪麻黄碱（880.60±287.97）ng/g > 苦杏仁苷（304.43±234.70）ng/g > 橙皮苷（78.33±38.38）ng/g > 次野鸢尾黄素（8.62±4.66）ng/g > 黄芩苷（8.53±1.91）ng/g > 金丝桃苷（7.72±1.63）ng/g > 甘草苷（7.68±5.19）ng/g；2 h时成分含量为麻黄碱（776.61±148.40）ng/g > 野黑樱苷（325.20±104.17）ng/g > 伪麻黄碱（212.21±44.63）ng/g > 黄芩苷（71.72±23.96）ng/g > 苦杏仁苷（46.39±36.45）ng/g > 橙皮苷（13.39±10.99）ng/g > 金丝桃苷（3.11±0.75）ng/g > 甘草苷（2.86±0.46）ng/g；4 h时各成分质量分数为麻黄碱（327.61±212.59）ng/g > 野黑樱苷（173.77±58.21）ng/g > 伪麻黄碱（84.68±59.04）ng/g > 黄芩苷（49.33±17.06）ng/g > 苦杏仁苷（1.26±0.26）ng/g。结论 研究建立的UHPLC-Q-Orbitrap HRMS方法可实现清肺排毒汤中多种化学成分的快速、准确分析，并明确了ig给药后清肺排毒汤主要成分在小鼠的组织分布情况，为后续清肺排毒汤的药效物质基础研究及进一步的临床应用提供了药动学信息和指导。]]> 2020/4/19 10:52:24 40true 目的 回顾性评价清肺排毒汤加减方治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的临床疗效。方法 选取2020年1月24日-2020年3月7日在湖北省第三人民医院就诊的符合COVID-19确诊标准的出院病历资料60例，按照治疗方法的不同分为对照组和联合用药组，联合用药组30例采用常规治疗（营养支持、呼吸支持、抗病毒药物治疗）联合清肺排毒汤加减方，对照组30例仅采用常规治疗，比较两组患者临床治愈率、主要症状消失时间及有关检测指标好转时间。结果 联合用药组患者住院天数显著低于对照组（P<0.05），联合用药组与对照组治愈率分别为90.00%和83.33%，两组差异不显著（P>0.05）。与对照组相比，联合用药组退热时间、咳嗽好转时间及肺部CT好转时间显著缩短（P<0.05），两组患者治疗过程中病情加重情况差异不显著（P>0.05）。结论 较单纯抗病毒药物，清肺排毒汤加减方联合抗病毒药物能显著缩短COVID-19患者住院时间、临床症状好转时间及肺部CT好转时间。]]> 2020/4/19 10:52:24 39true 目的 回顾性分析新型冠状病毒肺炎（COVID-19）重症患者103例的临床资料，探讨中西医结合治疗COVID-19重症的临床疗效。方法 收集本院2个院区2020年1月27日-2020年3月1日收治的103例治疗完整的COVID-19重型、危重型患者病历资料，包括出院、好转转出、死亡病例。根据当时的治疗方案，分为对照组和中西医结合组，对中西医结合（常规治疗＋中药）组患者51例和对照组（常规治疗）患者52例的基本信息，实验室检查，肺部CT吸收情况，住院天数，转归等进行比较分析。结果 中西医结合组51例，年龄（61.57±1.84）岁，男性28例，对照组52例，年龄（66.46±2.29）岁，男性24例，中西医结合组治疗后患者淋巴细胞绝对值明显升高，中西医结合治疗组患者的C反应蛋白（CRP）经治疗后有一定程度的降低，并且与对照组治疗后相比明显降低（P<0.001）。对照组治疗前后患者的白蛋白未见增高且有下降趋势，中西医结合组治疗后患者白蛋白含量升高，且明显高于对照组治疗后的白蛋白含量，差异显著（P<0.01），治疗后中西医结合组患者肺部吸收好转病例数明显高于对照组（P<0.05）。中西医结合组患者的死亡率低于对照组，治愈率高于对照组，中西医结合治疗COVID-19重症患者，能有效减轻炎症反应，改善预后，从而提高疗效。结论 中西医结合治疗COVID-19重症患者疗效确切，中药可有效减轻炎症反应，改善预后，对COVID-19的临床治疗有一定的指导意义。]]> 2020/4/19 10:52:24 38true 2020/4/19 10:52:24 37true 2020/4/19 10:52:24 36true 2020/7/31 9:17:14 35true 2020/3/26 14:35:46 34true 2020/3/26 14:35:46 33true 目的 通过网络药理学及分子对接技术探寻抗病毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的潜在物质基础。方法 借助TCMSP检索抗病毒颗粒中板蓝根、连翘、石膏、知母、芦根、地黄、广藿香、石菖蒲、郁金的化学成分和作用靶点。通过UniProt数据库查询靶点对应的基因，进而运用Cytoscape 3.6.1构建药材-化合物-靶点（基因）网络，通过DAVID进行基因本体（GO）功能富集分析和KEGG通路富集分析，预测其作用机制，将药材-化合物-靶点网络中排名前15的成分与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶进行分子对接，同时将比枯枯灵、木犀草素、槲皮素与血管紧张素转化酶II（ACE2）进行分子对接。结果 药材-化合物-靶点（基因）网络包含药材8个、化合物75个、靶点255个。GO功能富集分析得到GO条目161个（P<0.05），其中生物过程（BP）条目65个，细胞组成（CC）条目36个，分子功能（MF）条目60个。KEGG通路富集筛选得到131条信号通路（P<0.05）。分子对接结果显示抗病毒颗粒中比枯枯灵、木犀草素、槲皮素等核心活性化合物与SARS-CoV-2 3CL水解酶的亲和力与临床推荐化学药相似。结论 抗病毒颗粒中的活性化合物比枯枯灵、木犀草素、槲皮素等能通过与ACE2结合作用于PTGS2、HSP90AB1、PTGS1等靶点调节多条信号通路，从而可能发挥对COVID-19的治疗作用。]]> 2020/3/26 14:35:46 32true 目的 基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP，运用计算机虚拟筛选技术寻找新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶的中药小分子抑制剂，推测潜在抗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）中药及中药复方。方法 以SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白为靶点，利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接，结合"ADME-Lipinski"规则进行再次筛选，以优选活性成分，推测关键中药及复方。基于网络药理学角度，构建成分-靶点-通路网络，推测核心药对的作用机制。结果 以SARS-CoV-2原配体为阳性对照，筛选出66个药动学性质良好的天然小分子抑制剂，优选出12味中药单味药，2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘，以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗SARS-CoV-2的候选方案。结论 基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药，结合网络药理学分析潜在分子机制，为中药抗击SARS-CoV-2提供了科学指导与理论依据。]]> 2020/3/26 14:35:46 31true 2020/3/26 14:35:46 30true 2020/3/26 14:35:47 29true 2020/3/26 14:35:47 28true 2020/3/26 14:35:47 27true 2020/3/26 14:35:47 26true 目的 分析新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者死亡的影响因素，为临床上减少COVID-19患者的病亡率提供参考。方法 回顾性分析本院2020年1月17日-2月25日期间所有COVID-19入院患者的病例资料，收集患者的性别、年龄、住院期间是否服用中药制剂、临床分型、合并症、核酸检测结果、入院时间、出院情况等相关指标进行统计分析。结果 COVID-19疫情期间，本院COVID-19患者的在院人数逐渐增多，最高峰期曾同时收治904名COVID-19患者。在2020年1月17日-2月25日期间本院共收治1 305例COVID-19患者，其中男性632例，女性673例，男女比例1：1.06。年龄分布在7~101岁，中位数为63（51，70）岁。不同性别之间，患者的年龄分布无明显差异。单因素分析结果显示患者的性别、年龄、治疗期间是否服用中药制剂、临床分型、是否合并基础疾病（高血压、冠心病、糖尿病、肿瘤及尿毒症）以及核酸检测结果均可影响患者的病亡率。Logistics多因素回归分析发现，服用中药制剂、临床分型以及是否合并基础疾病是COVID-19患者病亡的独立危险因素。结论 COVID-19患者死亡与多种因素有关，减少危重症的发生，控制基础疾病，稳定血压血糖，积极改善心脑血管条件及稳定肾功能等是提高COVID-19患者治疗效果的主要措施，并且早期应用中药治疗对减少COVID-19病亡率同样具有十分重要的作用。]]> 2020/3/26 14:35:47 25true 目的 收集新型冠状病毒肺炎（COVID-19）临床症状，探索、分析《温病条辨》中与COVID-19相关的条文、方药，为临床治疗COVID-19遣方用药提供参考。方法 以"新型冠状病毒""2019 Novel Coronavirus"为检索词在数据库CNKI和PubMed进行文献检索，将文献中出现的症状按频数分类，并与《温病条辨》中相关症状对比，结合《新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第六版）》分析相关条文及方药。结果 共纳入中英文文献20篇，累计报道样本647例。临床表现共计28种，分为呼吸道症状，如发热、咳嗽等；消化道症状，如食欲减退、恶心呕吐、腹泻等；其他症状，如肌痛、乏力等。其中发热（558例）、咳嗽（395例）、乏力（257例）3种症状出现次数最多。通过分析，筛选《温病条辨》中对应的条文15条、方剂18首、药物46种。其中上焦篇条文2条，中焦篇条文9条，下焦篇条文4条。治疗湿热类方剂7首，寒湿5首，温热6首。药物出现次数较多的为半夏（6次），桂枝、通草（各5次），茯苓、滑石、黄连、薏苡仁（各4次）。湿温类疾病主要以半夏、桂枝、黄连、黄芩、干姜等辛开苦泄，以茯苓、通草、滑石、薏苡仁等淡渗利湿，以杏仁、白豆蔻、厚朴等开通气机；对于温热病，主要以知母、生石膏、连翘等清热泻火解毒。在疾病医学观察期可选用三仁汤、薏苡竹叶散；临床治疗期轻型、普通型可参照选用三仁汤、薏苡竹叶散、杏仁薏苡汤、五苓散、白虎加桂枝汤、苓姜术桂汤等，重型可参照选用黄芩滑石汤、杏仁滑石汤、茯苓皮汤；危重型可参照选用椒梅汤、减味乌梅丸、四逆汤、桃花粥；恢复期可参照选用麦冬麻仁汤、五汁饮、牛乳饮等。结论 经典指导临床，《温病条辨》所载方药可为临床治疗COVID-19提供参考。]]> 2020/3/26 14:35:47 24true 2020/3/26 14:35:47 23true 2020/3/11 16:40:27 22true 2020/3/11 16:40:27 21true 2020/3/11 16:40:27 20true 目的 采用网络药理学与分子对接法探索藿香正气口服液预防新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的活性化合物。方法 借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索藿香正气口服液组方中苍术、陈皮、厚朴、白芷、茯苓、大腹皮、半夏、甘草、广藿香、紫苏的化学成分和作用靶点。通过Uniprot数据库查询靶点对应的基因，进而运用Cyoscape 3.7.2软件构建药材-化合物-靶点（基因）网络进行可视化，通过DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析，预测其作用机制，并通过Prism软件及Omicshare数据库绘制柱状图及气泡图进行可视化。结果 药材-化合物-靶点网络包含了10种药材，123个化合物和相应靶点基因257个，关键靶点基因涉及PTGS2、HSP90AB1、AR、CAMSAP2、PPARG、NOS2等。GO功能富集分析得到GO条目278个（P<0.05），其中生物过程（BP）条目178个，细胞组成（CC）条目36个，分子功能（MF）条目64个。KEGG通路富集分析筛选得到119条信号通路（P<0.05），涉及乙型肝炎、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、膀胱癌、前列腺癌及T细胞受体通路等。分子对接结果显示槲皮素、异鼠李素、葛花苷元、山柰酚、汉黄芩素、黄芩素等核心化合物与COVID-19推荐药的亲和力相似。其中以槲皮素、异鼠李素、葛花苷元3者亲和力最强。结论 藿香正气口服液中的化合物能通过与血管紧张素转化酶II（ACE2）结合作用于PTGS2、HSP90AB1、AR、CAMSAP2等靶点调节多条信号通路，从而发挥对COVID-19的防治作用。]]> 2020/3/11 16:40:27 19true 目的 以血管紧张素转换酶II（ACE2）为受体探讨中药及单体成分治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制。方法 借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索作用于ACE2受体的中药及单体成分。通过UniProt、GeneCards等数据库查询中药单体成分作用靶点对应的基因名，进而运用Cytoscape 3.6.1构建化合物-靶点（基因）网络，通过DAVID进行基因本体（GO）功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，预测其作用机制。结果 葛根素-靶点网络中靶点54个，关键靶点涉及AKT1、VEGFA、TNF等。GO功能富集分析得到GO条目554个（P<0.05），其中生物过程（BP）条目486个，细胞组成（CC）条目26个，分子功能（MF）条目42个。KEGG通路富集筛选得到162条信号通路（P<0.05），涉及小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肾素-血管紧张素系统通路等。分子对接结果显示葛根素与ACE2和新型冠状病毒（SARS-CoV-2）水解酶的亲和力与推荐用药相近。结论 葛根素与ACE2结合作用于AGTR1、NOS3、HIF1A等靶点调节多条信号通路，从而可能对COVID-19有治疗作用。]]> 2020/3/11 16:40:28 18true 2020/3/11 16:40:28 17true 2020/3/11 16:40:28 16true 2020/3/11 16:40:28 15true 2020/3/11 16:40:28 14true 2020/3/11 16:40:28 13true 目的 回顾性研究分析疏风解毒胶囊联合阿比多尔治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的临床疗效。方法 选取2020年1月31日—2020年2月11日于COVID-19定点收治医院亳州市人民医院诊断并治疗的COVID-19患者70例，按治疗方法的不同，分为联合用药组（40例）和阿比多尔组（30例），两组均予常规阿比多尔口服，联合用药组在此基础上予口服疏风解毒胶囊治疗，疗程10 d。对比两组患者的退热时间及干咳、鼻塞、流涕、咽痛、乏力、腹泻等症状消失时间，比较两组患者的新型冠状病毒（SARS-CoV-2）转阴率及转阴时间。结果 联合用药组患者退热时间及干咳、鼻塞、流涕、咽痛、乏力、腹泻消失时间均较阿比多尔组显著缩短（P<0.05），治疗10 d后，联合用药组患者治愈出院6例，阿比多尔组出院1例；第10天复查咽拭子，联合用药组12例1次阴性、阿比多尔组7例1次阴性；联合用药组SARS-CoV-2转阴时间较阿比多尔组显著缩短（P<0.05）。结论 疏风解毒胶囊联合阿比多尔治疗COVID-19优于单用阿比多尔，能显著缩短患者临床症状的好转时间和SARS-CoV-2转阴时间。]]> 2020/3/11 16:40:28 12true 目的 收集清肺排毒汤（QFPDT）的主要活性成分、靶标，探讨其靶标与新型冠状病毒肺炎（COVID-19）之间的联系以及多成分、多靶标的治疗机制。方法 从ETCM、TCMID、NPASS数据库搜索QFPDT每味中药的归经、成分和靶标，用Cytoscape软件构建和分析网络，用DAVID和STRING对靶标进行功能富集分析。结果 QFPDT里的中药大多数归肺经，其790个潜在靶标中的232个与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的受体血管紧张素转化酶II（ACE2）是共表达的；靶标包含7个两两相互作用的核糖体蛋白；重要靶标富集在病毒感染和肺部损伤2大类疾病通路上，且与HIV病毒的6个蛋白具有密切的相互作用；重要靶标调控内分泌系统、免疫系统、信号转导、翻译等生物学过程的一系列信号通路。结论 QFPDT通过多成分、多靶标对机体起到整体调控作用。其首要作用部位是肺，其次是脾；通过调控若干与ACE2共表达的蛋白以及与疾病发生发展密切相关的一系列信号通路，起到平衡免疫、消除炎症的作用；靶向病毒复制必需的蛋白——核糖体蛋白而抑制病毒mRNA翻译，并抑制与病毒蛋白相互作用的蛋白而起到抗病毒作用。]]> 2020/3/2 0:00:00 11true 目的 探寻达原饮治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的活性化合物。方法 借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索达原饮中槟榔、厚朴、草果、知母、白芍、黄芩、甘草的化学成分和作用靶点。通过UniProt、GeneCards等数据库查询靶点对应的基因，进而运用Cytoscape3.2.1构建化合物-靶点（基因）网络，通过DAVID进行基因本体（GO）功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，预测其作用机制。结果 化合物-靶点网络包含141个化合物和相应靶点267个，关键靶点涉及PTGS2、HSP90AA1、ESR1、AR、NOS2等。GO功能富集分析得到GO条目522个（P<0.05），其中生物过程（BP）条目421个，细胞组成（CC）条目38个，分子功能（MF）条目63个。KEGG通路富集筛选得到25条信号通路（P<0.05），涉及小细胞肺癌、非小细胞肺癌、T细胞受体信号通路等。分子对接结果显示槲皮素、山柰酚、黄芩素等核心化合物与COVID-19推荐用药的亲和力相似。结论 达原饮中的活性化合物可能通过与血管紧张素转换酶II（ACE2）结合作用于PTGS2、HSP90AA1、ESR1等靶点调节多条信号通路，从而有可能对COVID-19有治疗作用。]]> 2020/3/2 0:00:00 10true 目的 采用文献挖掘与分子对接技术相结合的方法筛选潜在的中药抗新型冠状病毒（SARS-CoV-2）活性成分。方法 通过近期国家及各权威机构发布的防治新型冠状病毒肺炎（COVID-19）方案的中医方剂以及常用抗病毒中药筛选候选中药，通过TCMSP、CNKI及PubMed搜集整理候选中药活性成分。SARS-CoV-2 3CL水解酶（Mpro）蛋白结构由上海科技大学饶子和院士团队提供。采用AutoDock Vina进行分子对接。结果 通过文献查阅与处方筛选共得到11个高频使用抗病毒待研究中药，通过TCMSP及文献查阅整合得到469个候选活性成分。通过分子对接得到结合能<-33.44 kJ/mol的成分41个，其中柴胡皂苷（E、B1、D、F、B2、C2、A）、甘草酸等多种成分与SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白均有较好的亲和力。候选药物中柴胡、甘草、金银花等中药含有较多潜在抗SARS-CoV-2活性成分。结论 从传统抗病毒中药中筛选出潜在的抗SARS-CoV-2中药单体，为抗SARS-CoV-2药物研究及处方筛选提供参考。]]> 2020/3/2 0:00:00 9true 2020/3/2 0:00:00 8true 2020/3/2 0:00:00 7true 2020/3/2 0:00:00 6true 2020/3/2 0:00:00 5true 2020/3/2 0:00:00 4true 2020/3/2 0:00:00 3true 2020/3/2 16:57:17 2true Artemisiae Argyi Folium、苍术Atractylodis Rhizoma和白芷Angelicae Dahuricae Radix等性味香燥的中药材熏蒸进行防疫是我国古代医家在千百年来同疫病斗争过程中独特的创造。现有研究肯定了中药材熏蒸在临床实践中的应用，且有明确药理研究证明其相关有效成分。对艾草、苍术及避疫方防疫的相关历史沿革及现代研究进展进行综述，针对目前新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019，COVID-19）聚集性发病的主要特点及其空气飞沫传播，甚至可能出现的气溶胶传播的背景下，推荐合理运用中医药熏蒸，并在医院、社区和家庭等场合使用，有望发挥抗击疫情的重要作用。]]> 2020/3/2 16:57:17 1true