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<title cf:type="text"><![CDATA[《中草药》杂志编辑部 -->网络药理学专栏]]></title>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[整合药理学方法的心可舒片干预动脉粥样硬化作用网络机制探讨]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181502]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 探究心可舒片干预动脉粥样硬化（AS）作用的分子机制，对于心可舒片二次开发和临床应用提供参考。<b>方法</b> 用整合药理学平台对心可舒片干预AS的关键靶点和通路进行预测，探究其干预AS的分子机制。<b>结果</b> 通过建立心可舒片“中药-成分-靶点-通路”网络进行预测和分析，得到相关有效成分80个，确定了B4GALT4、B4GALT2、PRKCD、GCK、GNB1等关键靶点，明确了内分泌系统、甲状腺激素、神经系统、雌性激素和趋化因子等富集通路与其抗AS作用相关。<b>结论</b> 心可舒片通过对PI3K/Akt/eNOS和Raf/MEK/ERK途径的共同调节，保护血管内皮细胞，从而达到干预AS的效果。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:23</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[李晓宇,徐男,黄娜娜,吴成胜,刘闰平,郭文鹤,李晓骄阳,孙蓉]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181502]]></guid><cfi:id>19</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的半枝莲抗肿瘤活性成分及整合作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181503]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 利用网络药理学方法探索半枝莲抗肿瘤的活性成分和分子作用机制。<b>方法</b> 采用类药五原则筛选活性成分，经分子对接获得半枝莲活性成分的靶蛋白并于CTD数据库中获得靶点相对应的疾病，运用网络可视化软件，构建分子-靶点-疾病相互作用网络；同时进行蛋白质相互作用分析，通过生物学信息注释库（DAVID）对靶点进行生物代谢通路分析。<b>结果</b> 半枝莲中有72个活性成分可与14个以上的肿瘤相关靶蛋白相互作用，半枝莲临泉生物碱D、barbatellarine E、半枝莲碱A等在内的二萜类成分是半枝莲抗肿瘤的主要活性成分。网络分析显示，半枝莲主要活性成分可作用于蛋白酪氨酸磷酸酶1B（PTP1B）、碳酸酐酶2（CA2）、周期蛋白依赖性激酶（CDK2）、视黄酸α受体（RXRA）等关键靶蛋白，参与调控VEGF信号通路、FcεRI信号通路以及FoxO信号通路。<b>结论</b> 半枝莲可通过抗炎、抑制肿瘤血管生成等过程发挥多靶点、多通路的协同抗肿瘤作用。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:23</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[杨沙,段灿灿,晏仁义,张建永]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181503]]></guid><cfi:id>18</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[逍遥散和开心散“同病异治”抑郁症的网络药理学作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181504]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 采用网络药理学的方法，研究逍遥散与开心散的活性成分、作用靶点及生物学意义，探讨其“同病异治”抑郁症的作用机制。<b>方法</b> 采用TCMID、Batman-TCM、TCM database@Taiwan分别获取逍遥散和开心散的成分和靶点，通过TTD、PharmGkb、CTD、Genecard、OMIM、DrugBank筛选抑郁症相关的蛋白，构建蛋白相互作用网络（PPI），通过Cytoscape的Network Analyzer工具进行靶点的拓扑属性分析，运用其插件ClusterViz的MCODE算法进行聚类分析，DAVID通路进行生物过程和通路富集分析。<b>结果</b> 网络分析结果表明两方可能通过INS、AKT1、TP53、IL6、CREB1等关键蛋白，神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、5-羟色胺能神经突触、Calcium信号通路和胆碱能突触发挥抗抑郁的作用。PIK3CA、BDNF、PIK3R1、NGF蛋白所在的PI3K-Akt、钙离子等信号通路为逍遥散特有的抗抑郁机制；CCND1、PRKACA、GCLM、GCLC蛋白所在的Oxytocin信号通路、胆碱能突触等通路为开心散特有的抗抑郁机制。<b>结论</b> 逍遥散和开心散由于组方差异，在抗抑郁靶点方面既有相同也有不同；通过对靶点和通路的分析初步阐明抑郁症“同病异治”的科学内涵。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:23</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[高耀,吴丹,田俊生,周玉枝,高晓霞,秦雪梅]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181504]]></guid><cfi:id>17</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的降脂理肝汤治疗非酒精性脂肪肝病作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181505]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 筛选降脂理肝汤主要活性成分，预测其活性成分的作用靶点，探讨降脂理肝汤治疗非酒精性脂肪肝病（non-alcoholic fatty liver disease，NAFLD）的多成分-多靶点-多通路作用机制。<b>方法</b> 通过多个数据库联合检索并筛选降脂理肝汤活性成分和其作用靶点以及NAFLD相关靶点，并预测降脂理肝汤治疗NAFLD的潜在靶点。采用Cytoscape软件构建降脂理肝汤活性成分-作用靶点网络，通过Cytoscape的插件ClueGO对靶点基因功能及通路进行富集分析。<b>结果</b> 网络分析结果表明，从降脂理肝汤中筛选得到82个活性成分，涉及NAFLD靶点53个，靶点主要关联NAFLD中胰岛素抵抗、氧化应激和炎症反应，并且参与了NAFLD中PI3K/Akt信号通路、炎症小体途径、白细胞介素-10（IL-10）信号通路以及T细胞信号通路，这些生物过程和信号通路介导了降脂理肝汤干预NAFLD潜在机制。<b>结论</b> 为进一步深入研究降脂理肝汤治疗NAFLD作用机制提供了重要依据。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:23</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[唐标,邓常清]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181505]]></guid><cfi:id>16</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[桔梗汤止咳祛痰的网络药理学研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181506]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 探索桔梗汤止咳祛痰功效的潜在活性成分群和分子作用机制。<b>方法</b> 在文献挖掘、多个数据库联用检索与痰多咳嗽相关靶蛋白基础上，利用分子计算结合网络特征分析获得桔梗汤的主要活性成分和潜在的靶点蛋白，并构建分子-蛋白调控网络。<b>结果</b> 基于痰多咳嗽相关病变机制，初步筛选出38个靶蛋白和472个小分子；分子对接结果中发现桔梗汤中78个分子（结构特征分析均符合“类药五原则”）与靶蛋白相互作用的对接得分较高（Score≥7），其中5个成分来自桔梗，73个成分来自甘草。依据分子对接结果，选取对接得分较高（Score≥7）的128条分子-靶蛋白数据对，通过插件Network analyzer分析网络特征，识别出桔梗汤26个主要活性成分（皂苷和黄酮类化合物等）和13个靶蛋白。<b>结论</b> 桔梗汤主要通过其所含的皂苷、黄酮类化合物与TLR4、MMP9、IKK2等多个靶蛋白的作用，起到调控呼吸道过度炎症反应、改善肺功能、抑制黏蛋白过表达、降低咳嗽中枢对刺激反应等作用，最终实现止咳祛痰功效。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:24</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[单进军,杨瑞,张新庄,沈存思,纪建建,谢彤,徐建亚,狄留庆]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181506]]></guid><cfi:id>15</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的网络药理学研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181507]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分，并预测其作用机制。<b>方法</b> 从中药系统药理学分析平台（TCMSP）中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点，同时利用OMIM、TTD和PharmGkb数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标。采用Excel筛选分子和靶标，Cytoscape软件建立柴胡疏肝散的中药成分-靶点网络图，通过生物学信息注释数据库（DAVID）对基因功能及代谢通路进行分析。<b>结果</b> 从数据库筛选出柴胡疏肝散122个中药成分与卒中后抑郁的42个靶蛋白相互作用，其中雌激素受体（ESR1）、前列素内环氧化物合成酶2（PTGS2）、糖原合成酶激酶3β（GSK3β）、SLC6A4和白三烯A4水解酶（LTA4H）为柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的作用靶点，主要涉及花生四烯酸代谢通路、5-羟色胺能突触通路、催乳素信号通路和甲状腺激素信号通路，通过调节炎症应答、突触合成、雌激素应答、记忆、生物合成、药物反应和昼夜节律从而治疗卒中后抑郁。<b>结论</b> 通过网络药理学研究揭示了柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的可能机制，为进一步阐明其作用靶点奠定了基础。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:24</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[盛蕾,刘元月,胡丹,范琪琪,朱亦诚,张晓浩,凌志香,江雪梅,丁彩霞,肖婧,汤银燕,李传游,张兰坤,李婷婷,朱羽佳,陆茵]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181507]]></guid><cfi:id>14</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[骨碎补治疗骨关节炎的网络药理学研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181508]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 基于网络药理学和生物信息学研究骨碎补治疗骨关节炎（OA）可能的分子机制。<b>方法</b> 通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）对骨碎补可能的生物活性成分和靶点进行筛选和预测，通过TTD等5个数据库挖掘骨关节炎相关的作用靶点，采用ClueGo分析骨碎补治疗OA可能的分子机制。<b>结果</b> 从TCMSP检索出71个骨碎补相关成分，根据口服生物利用度（OB）和药物相似性（DL）值筛选获得生物活性成分18个，同时预测出92个可能的作用靶点；通过相关数据库共检索到与OA密切相关的靶点168个；拓扑分析筛选出骨碎补治疗OA的99个关键靶点；ClueGO分析显示，骨碎补治疗OA的关键靶点主要涉及细胞周期、炎症、感染、癌症相关等31条信号通路。<b>结论</b> 骨碎补治疗OA具有多系统、多成分、多靶点的特点；其可能的作用机制包括直接参与骨重建的细胞增殖、凋亡及分化，调节成骨、破骨代谢平衡，以及调节免疫、炎症反应等干预和影响骨微环境以达到控制疾病发生发展的目的，与目前治疗OA的作用机制相符合。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:24</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[骆帝,许波,李刚,梁学振,刘杰,李嘉程,夏聪敏,阎博昭,盖帅帅]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181508]]></guid><cfi:id>13</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的黄芩抗炎作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181509]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 运用网络药理学的方法探究黄芩抗炎的作用机制。<b>方法</b> 通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库搜索黄芩中的成分，结合“类药五原则”与“口服生物利用度>30%”筛选黄芩活性成分。采用PharmMapper网络服务器预测其作用靶点，并采用Cytoscape 3.4.0软件构建黄芩活性成分-预测靶点网络。在TTD数据库中以“Anti-inflammatory”为关键词搜索抗炎靶点，使用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析，构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，并将其与活性成分-预测靶点融合，获得黄芩活性成分的抗炎作用靶点。使用DAVID数据库对黄芩抗炎作用靶点进行KEGG通路富集分析，以探究黄芩抗炎的作用机制。<b>结果</b> 获得黄芩中具有类药性、口服吸收良好的28个成分，包括黄芩苷、黄芩素、汉黄芩苷、汉黄芩素等黄酮类成分，表小檗碱、黄连碱等生物碱类成分以及二氢木蝴蝶素等酚类物质。黄芩抗炎作用的主要靶点有丝裂原活化蛋白激酶14（MAPK14）、肿瘤坏死因子受体超家族成员1A（TNFRSF1A）、表皮生长因子受体（EGFR）、E-选择素（SELE）等。其中丹参素、表儿茶素、黄连碱等成分主要作用于MAPK14；红花素等作用于TNFRSF1A；二氢木蝴蝶素A、5，7，4'-三羟基-8-甲氧基黄酮、5，7，4'-三羟基-8-甲氧基黄烷酮、黄芩苷等成分主要作用于EGFR。KEGG分析得到与黄芩抗炎作用有关的通路11条，主要涉及肿瘤坏死因子信号通路、MAPK信号通路等。<b>结论</b> 黄芩中的活性成分主要通过MAPK14、EGFR、TNFRSF1A、SELE等靶点抑制炎症因子的产生、抑制炎症因子与相应受体结合、阻断炎症反应的启动等，最终发挥抗炎效应。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:24</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[雷奇林,黄雅兰,钟茜,梁杰,吴雨晴,苏青]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181509]]></guid><cfi:id>12</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的脑震宁颗粒治疗脑外伤的机制分析]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181510]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 借助网络药理学技术预测脑震宁颗粒主要成分的潜在作用靶点，探讨其治疗脑外伤多成分-多靶点-多通路的作用机制。<b>方法</b> 依据反向分子对接服务器（DRAR-CPI）和CooLGeN数据库预测和筛选脑震宁颗粒主要成分的作用靶点；采用Cytoscape软件ClueGO插件对靶点进行GO富集分析，借助生物信息学注释数据库（DAVID）对获取的靶点信息进行KEGG通路注释分析；采用Cytoscape软件构建药材-成分-靶点-通路-疾病网络。<b>结果</b> 脑震宁颗粒的33个主要成分涉及丝裂原活化蛋白激酶-1（MAPK1）、<i>胱天蛋白酶</i>-3（CASP3）、糖原合成酶激酶-3β（GSK3B）等34个靶点，GO富集分析和KEGG通路注释分析提示脑震宁颗粒可作用于活性氧的生物合成、平滑肌细胞增殖等生物过程，以及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）、MAPK通路、JAK/STAT、mTOR等信号转导通路；网络分析显示脑震宁颗粒的作用机制可能与调控氧化应激、抑制炎症反应和神经细胞凋亡、调节脑内硫化氢生成和纤溶酶原（PLG）活性、改善认知功能及脑外伤后抑郁等相关。<b>结论</b> 揭示了脑震宁颗粒多成分、多靶点、多通路的作用机制，为进一步深入研究脑震宁颗粒药效物质基础及作用机制奠定了基础。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:24</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[卢紫娟,刘海霞,李昆,秦正国,秦雪梅,杜冠华,朱平,李震宇]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181510]]></guid><cfi:id>11</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的血必净注射液治疗急性肺损伤作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181511]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 预测血必净注射液抗急性肺损伤主要活性成分的作用靶点，探索其“多成分-多靶点-多通路”的复杂网络调节机制。<b>方法</b> 针对血必净注射液中38个主要活性成分，利用反向分子对接技术预测活性成分的作用靶点，并与通过文献挖掘及多种数据库检索得到的急性肺损伤疾病相关靶点进行比对；采用Cytoscape软件构建蛋白互作网络并进行拓扑分析，筛选血必净注射液抗急性肺损伤的关键靶点，借助DAVID数据库对得到的关键靶点进行GO富集分析和KEGG通路注释分析。<b>结果</b> 网络分析结果显示，血必净注射液中38个化合物直接或间接作用于143个关键靶点，共涉及71个生物学过程、29种细胞组分、40种分子功能及25条KEGG通路（<i>P</i> < 0.05，FDR < 0.05），说明血必净注射液主要通过对基因调控、蛋白合成、炎症反应等过程的调节和丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）等信号通路的干预发挥抗急性肺损伤作用。<b>结论</b> 血必净注射液发挥抗急性肺损伤的作用体现了中药多成分、多靶点、多途径的协同作用特点，为深入阐明血必净注射液治疗急性肺损伤的作用机制提供了重要的科学依据。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:24</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[左莉华,周霖,师莹莹,李卓伦,刘丽伟,姜晓芳,王丹,燕树勋,孙志,张晓坚]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181511]]></guid><cfi:id>10</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的黄芪建中汤治疗慢性萎缩性胃炎作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181512]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 筛选黄芪建中汤中治疗慢性萎缩性胃炎的主要活性成分，预测活性成分的作用靶点，建立单味药-活性成分-作用靶点网络，进一步探讨黄芪建中汤治疗慢性萎缩性胃炎的潜在作用机制。<b>方法</b> 采用中药系统药理学技术平台（TCMSP）中的药动学参数[口服利用度（OB）和药物相似性（DL）]筛选黄芪建中汤的潜在活性成分，整合靶点预测网站服务器（STPD）与人类基因数据库（Genecard）、人类孟德尔遗传数据库（OMIM）预测和筛选其治疗慢性萎缩性胃炎的作用靶点，借助Cytoscape构建“单味药-活性成分-作用靶点”网络。通过Systems Dock Web Site对4个主要活性成分与作用靶点进行分子对接验证。采用String数据库与Cytoscape软件绘制蛋白质相互作用网络，并利用DisGeNET数据库对作用靶点类型进行归属。采用DAVID数据库对黄芪建中汤作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。<b>结果</b> 通过OB和DL参数筛选得到118个潜在活性成分，共涉及16个作用靶点，与疾病靶点有关的活性成分为52个，主要通过调控癌症通路、病灶黏连、精氨酸和脯氨酸代谢、血管内皮生长因子（VEGF）信号转导与神经营养因子信号通路等发挥对慢性萎缩性胃炎的治疗作用。<b>结论</b> 黄芪建中汤对慢性萎缩性胃炎的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点，为阐释其治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制与物质基础提供了科学依据。]]></description>
<pubDate>2018/8/6 15:56:24</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[许文倩,秦雪梅,刘月涛]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20181512]]></guid><cfi:id>9</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[逍遥散“异病同治”抑郁症和糖尿病的网络药理学作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190809]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 构建逍遥散单味药-成分-共有靶点网络、蛋白相互作用网络，探究逍遥散“异病同治”抑郁症和糖尿病的共同作用机制。<b>方法</b> 通过TCM database@Taiwan、TCMID、Batman-TCM数据库结合文献挖掘获取逍遥散的化学成分和作用靶点，结合CTD、TTD、PharmGKB、OMIM、Gencards、Drugbank数据库获取逍遥散治疗抑郁症和糖尿病的作用靶点。采用Cytoscape软件绘制单味药-成分-共有靶点网络。采用Metascape工具对逍遥散治疗抑郁症和糖尿病的共有靶点进行GO生物过程分析、Reactome通路分析、KEGG通路分析、蛋白相互作用网络构建和模块分析。分别采用BioGPS、Genecards分析通路关键靶点的组织分布和亚细胞分布，并采用Cytoscape软件绘制组织-靶点、亚细胞-靶点网络。采用DisGeNET数据库对通路关键靶点进行蛋白归属。<b>结果</b> 逍遥散治疗糖尿病和抑郁症共病涉及免疫炎症反应，与G蛋白偶联受体、胰岛素及其受体、单胺类神经递质相关，通过调节环磷酸腺苷（cAMP）信号通路、钙信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路等实现。<b>结论</b> 逍遥散治疗抑郁症和糖尿病共病的作用机制涉及脑源性神经营养因子（BDNF）相关信号通路、G蛋白偶联受体、单胺类神经递质、胰岛素及其受体等调节过程，可为深入阐释逍遥散抗抑郁作用特点及其药理机制提供依据。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:00</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[吴丹,高耀,向欢,邢婕,韩雨梅,秦雪梅,田俊生]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190809]]></guid><cfi:id>8</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的黄芪治疗肾病综合征的机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190810]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 运用网络药理学的方法探讨黄芪治疗肾病综合征（NS）的分子作用机制。<b>方法</b> 通过TCMSP数据库和文献挖掘获取黄芪主要活性成分，利用PharmMapper服务器、GeneCards和CoolGeN数据库预测和筛选黄芪活性成分的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络，通过Systems Dock Web Site对成分与靶点进行分子对接验证。借助DAVID数据库对靶点进行GO分析和KEGG通路分析，采用Cytoscape软件构建成分-靶点-通路-疾病网络。<b>结果</b> 筛选得到黄芪25个活性成分，涉及47个作用靶点。网络分析结果表明，靶点主要涉及氧化应激、足细胞凋亡和脂质代谢等生物过程，通过调节Ras、Rap1、MAPK、PI3K-Akt和AGE-RAGE等信号通路来发挥治疗NS的作用。<b>结论</b> 黄芪中黄酮类、皂苷类等活性成分可能是其治疗NS的物质基础，其作用机制涉及抗细胞凋亡、抗氧化应激和调节脂质代谢等。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:00</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[杨柳,张王宁,刘月涛,李爱平,秦雪梅]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190810]]></guid><cfi:id>7</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[归肾经补阳药的网络药理学机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190811]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 运用网络药理学的方法对归肾经补阳药的分子作用机制进行预测。<b>方法</b> 选择归肾经补阳中药肉苁蓉、菟丝子、冬虫夏草、韭菜子、沙苑子、仙茅、续断以及胡芦巴作为研究对象，通过TCMSP数据库检索中药化学成分，利用口服生物利用度（OB）、类药性（DL）值筛选活性成分及PubChem数据库的化学相似性靶点预测方法对中药活性成分进行靶点预测；通过STRING数据库寻找归肾经补阳药靶蛋白之间的相互作用关系以及KEGG通路分析；通过加权PageRank算法评价蛋白互作（PPI）网络中的节点，并对信号通路进行打分。基于通路富集分析及PPI分析筛选核心靶蛋白。利用Cytoscape 3.6.0软件，分别构建化合物-关键靶点网络、药材-关键靶点PPI网络和关键靶点-通路网络，并对其作用机制进行了初步探讨。<b>结果</b> 筛选出归肾经补阳药核心靶蛋白21个，信号通路40条。归肾经补阳中药可能通过T细胞调节、性激素调节、免疫反应、延缓衰老等途径发挥温补肾阳的作用，其作用机制可能与甲状腺激素、神经营养因子、TNF及雌激素等信号通路有关。<b>结论</b> 基于网络药理学的研究方法有助于寻找归肾经补阳药的关键靶点和信号通路，为深入诠释补肾阳药的分类含义提供有益的信息和数据支撑。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:00</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[邹家丽,李安遥,王启铭,赵怡,于净,项荣武]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190811]]></guid><cfi:id>6</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[经典名方百合地黄汤的化学成分与网络药理学研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190812]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 利用色谱-质谱和网络药理学技术进行经典名方百合地黄汤的化学成分分析和药效成分作用机制的预测。<b>方法</b> 利用LC-MS、GC-MS技术分析百合地黄汤化学成分，利用TCMSP数据库分析搜集化学成分、靶点信息，利用TTD、CTD数据库搜集与靶点相关联的疾病，并以抑郁症为目标进行筛选。Cytoscape软件进行“化学成分-靶点-疾病”的网络图的构建，通过DAVID在线分析，对靶点进行KEGG通路分析，并探究其药效成分和作用机制。<b>结果</b> 通过色谱-质谱分析共得到了52种化学成分；通过网络药理手段得到百合地黄汤中的25种成分对应的31个靶点与抑郁症相关。<b>结论</b> 百合地黄汤治疗抑郁症具有“多向药理学”效应和“叠加”效应，体现中药复杂系统的作用特点；可能通过作用于31个靶点，调节信号通路，参与炎症反应、细胞凋亡、神经递质调节等过程，发挥治疗抑郁症的作用。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:01</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[丁腾,孙宇宏,杜霞,王乐,龚伟玲,彭秀娟,党艳妮,刘峰]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190812]]></guid><cfi:id>5</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的厚朴“发汗”科学内涵探究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190813]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 利用网络药理学方法建立厚朴“发汗”前后的差异成分-靶点网络，并探究厚朴“发汗”前后药理作用差异的分子机制，进而揭示其发汗的科学内涵。<b>方法</b> 通过查阅文献并筛选厚朴“发汗”前后的差异成分。利用Swiss Target Prediction预测差异成分的潜在靶点。利用STRING数据库筛选出最高置信度（得分0.900）的靶点并通过Cytoscape 3.6.0软件构建蛋白-蛋白互作网络。最后利用R Project中的clusterProfiler包对蛋白-蛋白互作网络进行GO注释和KEGG通路富集分析。<b>结果</b> 通过查阅文献共筛选出9种差异成分（阿西米诺宾、β-桉叶醇、和厚朴酚、厚朴三酚B、木兰花碱、厚朴酚、紫丁香苷、瑞枯灵和magnoloside A）并预测得到137个靶点（除重后共86个）。通过对蛋白-蛋白互作网络GO注释及通路富集分析，共得到550个GO注释和30条KEGG通路。<b>结论</b> 数据分析结果表明，“发汗”后厚朴药理作用的改变是化学成分相互作用的最终结果。其中，厚朴主要是通过5-羟色胺能突触、花生四烯酸代谢和钙信号通路发挥镇痛和抗胃溃疡作用。厚朴酚、和厚朴酚及β-桉叶醇等化学成分含量的改变是厚朴“发汗”前后疗效差异的主要原因。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:01</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[郑义蕾,王潇,刘芳,章津铭,胡慧玲,傅超美]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190813]]></guid><cfi:id>4</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[丹参对视网膜色素变性病理过程M&#252;ller细胞特征性基因变化及关键蛋白表达的影响]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190814]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 基于网络药理学和生物信息学方法探讨丹参（SM）通过干预M&#252;ller细胞（MC）特征性基因和关键蛋白表达治疗视网膜色素变性（RP）的分子机制。<b>方法</b> 运用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）检索、筛选SM的入血活性成分和作用靶点；通过GEO数据库获取正常和RP小鼠MC差异表达基因；通过疾病数据库检索RP相关的基因靶点；采用Cytoscape构建MC差异表达基因和疾病靶点、成分靶点的蛋白质-蛋白质交互作用网络并提取交集；运用DAVID数据库对特征性基因进行基因本体和KEGG通路分析；采用cytoHubba分析筛选关键蛋白靶点。<b>结果</b> 检索得到与SM相关的化学成分202个，依据ADME参数筛得活性成分65个，其中入血活性成分13个，进一步检索配对得到这些成分可能作用的靶点117个；从芯片数据中分析得到正常和RP小鼠MC中差异表达基因242个；从疾病数据库获得与RP密切相关的靶点206个；提取交集得到85个SM影响RP病理过程MC的特征性基因；这些基因主要涉及转录调控、凋亡信号通路调控、DNA核内复制调节等生物学过程，分子功能主要包括转录辅激活子活性、蛋白激酶活性、核心启动子结合等，富集于细胞核、核质、转录因子复合物、Rb-E2F复合体等区域，主要与剪接体信号通路、肌动蛋白细胞骨架调控信号途径、细胞周期调控通路等有关；分析筛选出SM干预RP病理过程MC中的8个关键蛋白靶点。<b>结论</b> SM药效作用的物质基础为隐丹参酮、木犀草素、丹参酮Ⅱ<sub>A</sub>等13个化学成分；其所干预的RP病理过程MC特征性基因与剪接体信号通路、肌动蛋白细胞骨架调控信号途径、细胞周期调控通路等机制相关，关键靶点包括RB1、E2F1、TFDP1等8个蛋白。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:01</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[宋厚盼,曾梅艳,彭俊,陈小娟,陈新怡,何卫波,杨毅敬,周亚莎,蔡雄,彭清华]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190814]]></guid><cfi:id>3</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的浙产栀子藏红花素类成分药理作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190815]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 运用网络药理学方法研究浙江产区栀子藏红花素类成分药理作用机制，为浙产栀子药材的合理使用与深度研发提供有价值的研究策略。<b>方法</b> 课题组前期研究成果显示，浙江产区栀子中藏红花素类成分含量与其他产地比较有显著性差异，依据该结果，本研究联合使用Pubchem、Uniprot、STITCH、SWISS、TCMSP多个在线靶点筛选与预测数据库，运用Cytoscape软件构建化学成分-靶点-疾病（component-target-disease，C-T-D）相关作用网络模型。对浙产栀子特征性高含量化学成分群藏红花素类化合物相关靶点进行挖掘预测，借助CTD数据库对靶点进行基因本体（gene ontology，GO）富集与KEGG通路分析，进一步挖掘浙产栀子多维药理作用机制。<b>结果</b> 浙产栀子中藏红花素类化合物藏红花素-二-β-<i>D</i>-龙胆二糖苷（crocin-1）、藏红花素-二-β-<i>D</i>-龙胆二糖-β-<i>D</i>-葡萄糖苷（crocin-2）通过成纤维细胞生长因子2（FGF2）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、酪氨酸激酶受体（KDR）、血管内皮生长因子受体1（FLT1）等18个靶点作用于G蛋白偶联受体（GPCR）、Rap1、RAS等信号通路，从而参与细胞信号转导过程发挥多维药理作用，这些成分主要可治疗心血管疾病、肿瘤、消化系统等18种相关疾病。<b>结论</b> 基于系统药理学的研究方法寻找不同产区药材特征性高含量化学成分群的关键靶点、信号通路和疾病网络，为深入研究我国不同产区中药资源的药理作用及机制提供信息和数据支撑。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:01</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[刘方舟,李园白,李萌,王静,杜昱,杨阳]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190815]]></guid><cfi:id>2</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的黄芪抗疲劳作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190816]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[<b>目的</b> 基于网络药理学方法探讨黄芪抗疲劳可能的作用机制。<b>方法</b> 根据课题组前期研究并结合中医药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）指认黄芪中的活性成分，采用PharmMapper网络服务器预测其作用靶点；在GeneCards、OMIM数据库中搜索抗疲劳靶点，采用Cytoscape 3.6.0软件构件黄芪活性成分-抗疲劳靶点网络；使用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析，构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，通过度值（degree）筛选关键靶点并进行归属；使用DAVID数据库对黄芪抗疲劳作用靶点进行基因本体（GO）富集分析和KEGG通路富集分析，以探究黄芪抗疲劳的作用机制。<b>结果</b> 获得黄芪中11种活性成分，包括毛蕊异黄酮葡萄糖苷、毛蕊异黄酮、芒柄花苷、芒柄花素、异黄烷、紫檀烷6种黄酮类成分，黄芪皂苷I、Ⅱ、Ⅲ、IV 4种皂苷类成分及蔗糖。黄芪抗疲劳作用预测靶点有76个，网络分析结果表明，黄芪主要涉及一氧化氮的生物合成、过氧化氢反应、棕色脂肪细胞分化的正调节、活性氧代谢等生物过程，通过调节癌症通路，FoxO、磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）-蛋白激酶B（Akt）、低氧诱导因子-1（HIF-1）、血管内皮生长因子（VEGF）、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、Ca<sup>2+</sup>信号通路、氧化应激反应等来发挥抗疲劳作用。<b>结论</b> 本研究体现了黄芪多成分-多靶点-多途径的作用特点，为进一步开展黄芪抗疲劳作用机制的研究提供了新思路和新方法。]]></description>
<pubDate>2019/4/19 11:30:01</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理学专栏]]></category>
<author><![CDATA[张瑞,曹庆伟,李爱平,刘月涛,李科,秦雪梅]]></author>
<guid><![CDATA[http://www.tiprpress.com/zcy/article/abstract/20190816]]></guid><cfi:id>1</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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